RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TBP	P20226	339 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	AADAC	P22760	399 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	PYDC2	Q56P42	97 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	MOB3B	Q86TA1	216 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	S100Z	Q8WXG8	99 aa		10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222		J3QRK9	145 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222		M0QYG6	137 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	CD74	P04233	296 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	CT45A6	P0DMU7	189 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	CT45A5	P0DMU8	189 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	CT45A7	P0DMV0	189 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	CD1B	P29016	333 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222		Q8N402	240 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	TRIM63	Q969Q1	353 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	C5orf30	Q96GV9	206 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	NABP2	Q9BQ15	211 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	SRR	Q9GZT4	340 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		10.86	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	SLC22A5	O76082	557 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	IGLV2-14	P01704	120 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	FAM106CP	P0CH98	169 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	TAS2R19	P59542	299 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF45	Q02386	682 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	EBI3	Q14213	229 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	BORCS5	Q969J3	196 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		10.85	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222		M0R1X1	148 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	RAB3D	O95716	219 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	IGKV1D-33	P01593	117 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	IGKV1-33	P01594	117 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	THBS3	P49746	956 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	LINC00205	P59089	165 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	HERV-K104	P61576	105 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	TSPAN5	P62079	268 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	MSMO1	Q15800	293 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ZNF329	Q86UD4	541 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	MOB3A	Q96BX8	217 aa		10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
CS-231	ENST00000552222	OR5H14	A6NHG9	310 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222		H0YJW9	148 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	MOS	P00540	346 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	IFNA6	P05013	189 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	AKAIN1	P0CW23	69 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	ECI1	P42126	302 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RAB25	P57735	213 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	FXYD4	P59646	89 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	HES1	Q14469	280 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	TMEM17	Q86X19	198 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222		Q8N6K4	173 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	ZNF383	Q8NA42	475 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.83	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	OR2F2	O95006	317 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	ZNF735	P0CB33	412 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	TMEM11	P17152	192 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	GNRHR	P30968	328 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	MC5R	P33032	325 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	MEF2D	Q14814	521 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		10.82	□□□□□ -0.68
CS-231	ENST00000552222	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		10.82	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms