RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PSENENQ9NZ42 101 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 ABCA1O95477 2261 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PRD5 423 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PRF3 423 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PRM7 423 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 I3L521 148 aa6.89□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 ATG12O94817 140 aa6.89□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.89□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 DYNLT3P51808 116 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 TNFRSF9Q07011 255 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 DTX2Q86UW9 622 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 STX12Q86Y82 276 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 OR4A16Q8NH70 328 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 C22orf46C9J442 243 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 CT45A6P0DMU7 189 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 CT45A5P0DMU8 189 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 CT45A7P0DMV0 189 aa6.88□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 OR4S2Q8NH73 311 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 STOML3Q8TAV4 291 aa6.88□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 CHODLQ9H9P2 273 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 TMEM140Q9NV12 185 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 27.7
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CS-215ENST00000549143 J3QR06 171 aa6.88□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 WNT2P09544 360 aa6.88□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 FHITP49789 147 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 RUNX1Q01196 453 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 AKR1C1Q04828 323 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.88□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 NRGNQ92686 78 aa6.88□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 RAB40CQ96S21 281 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 HRH4Q9H3N8 390 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 LPAR2Q9HBW0 351 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 MIOXQ9UGB7 285 aa6.88□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 IGFBP2P18065 325 aa6.87□□□□□ -1.31
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CS-215ENST00000549143 DTD1Q8TEA8 209 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 RNF141Q8WVD5 230 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PLXNB1O43157 2135 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 MED6O75586 246 aa6.87□□□□□ -1.31
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