RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	SULT1C2	O00338	296 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	CRYZL1	O95825	349 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	CA2	P00918	260 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	CRYGB	P07316	175 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	RFX2	P48378	723 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	TAS2R46	P59540	309 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	MSMO1	Q15800	293 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF695	Q8IW36	515 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	EHF	Q9NZC4	300 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		11.36	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	FCGR3B	O75015	233 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	IGLV1-40	P01703	118 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	PMP2	P02689	132 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	FXYD4	P59646	89 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	DYRK1A	Q13627	763 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	FXYD3	Q14802	87 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM65	Q6PI78	240 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	SCOC	Q9UIL1	159 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.35	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	TPPP	O94811	219 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	CD33	P20138	364 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	HLA-DMA	P28067	261 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	UBE2K	P61086	200 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	HERV-K104	P61576	105 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	DEFA6	Q01524	100 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	ARPC1A	Q92747	370 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	KLK15	Q9H2R5	256 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CTSB-231	ENST00000534382		A0A1W2PN81	502 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382		G3V4G9	280 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382		H3BMQ9	156 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	CTDSP2	O14595	271 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	RGS5	O15539	181 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	TNFSF12	O43508	249 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	CNIH1	O95406	144 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	RCVRN	P35243	200 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	HRH1	P35367	487 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	CHRNA7	P36544	502 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	MYCNOS	P40205	109 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	RAB9A	P51151	201 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	GNB1	P62873	340 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	OR4S2	Q8NH73	311 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	BORCS5	Q969J3	196 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	GPHA2	Q96T91	129 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	SOX15	O60248	233 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CTSB-231	ENST00000534382	GNRHR	P30968	328 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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