RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524555.3

SAA2-SAA4-201, Transcript of SAA2-SAA4 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SAA2-SAA4, Length 743 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGKV1-39P01597 117 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGKV1D-39P04432 117 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LYL1P12980 280 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NQO2P16083 231 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MC5RP33032 325 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ERVK-16P61578 105 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LCN2P80188 198 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q5BKY6 102 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 UTF1Q5T230 341 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PRSS54Q6PEW0 395 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF546Q86UE3 836 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q8N7P7 452 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OR4D5Q8NGN0 318 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa10.08□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.84e-10■■■■■ 37.9
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ACANP16112 2415 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 A0A0D9SG52 128 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAM90A26D6RGX4 464 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ST8SIA3O43173 380 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 S1PR2O95136 353 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CT45A6P0DMU7 189 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CT45A5P0DMU8 189 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CT45A7P0DMV0 189 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 EPHA1P21709 976 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 USF1P22415 310 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CEACAM3P40198 252 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RAB13P51153 203 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 BRWD1-AS2P59051 145 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RAB32Q13637 225 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OR2B11Q5JQS5 317 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PRSS57Q6UWY2 283 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CLEC9AQ6UXN8 241 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PNKDQ8N490 385 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF383Q8NA42 475 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OR1S1Q8NH92 325 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GPR146Q96CH1 333 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HSPB11Q9Y547 144 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 AKAP9Q99996 3911 aa10.07□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MARCH11A6NNE9 402 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LEUTXA8MZ59 168 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 E5RGE8 158 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 L7N2F9 121 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PITX3O75364 302 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DEDDO75618 318 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TOX4O94842 621 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OR2F2O95006 317 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KRASP01116 189 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGKV1-5P01602 117 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MMP9P14780 707 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HTR1DP28221 377 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 S100A10P60903 97 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OR2F1Q13607 317 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ZNF345Q14585 488 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PDPNQ86YL7 162 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RPEQ96AT9 228 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 R3HDM4Q96D70 268 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MFFQ9GZY8 342 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SIRPDQ9H106 197 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MBD2Q9UBB5 411 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TNFSF18Q9UNG2 199 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NSG2Q9Y328 171 aa10.06□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OOSP1A8MZH6 123 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 B4DSR2 109 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 K7EPK0 472 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 WRBO00258 174 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ARPC5O15511 151 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MED6O75586 246 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LY86O95711 162 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CRYZL1O95825 349 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SCGB1D2O95969 90 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MBPP02686 304 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ARG1P05089 322 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 P0C879 139 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GATA3P23771 443 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 COX7A1P24310 79 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 G6PCP35575 357 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ID3Q02535 119 aa10.05□□□□□ -0.8
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 POU2AF1Q16633 256 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms