RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 PACRGLQ8N7B6 248 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 NMNAT3Q96T66 252 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 YIPF3Q9GZM5 350 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 NAT8Q9UHE5 227 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIPA1L1O43166 1804 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 E9PCH4 1651 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRGMA1A4Y4 181 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX4O95219 450 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 CA7P43166 264 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 DHFR2Q86XF0 187 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC39Q96DD0 335 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 REREQ9P2R6 1566 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHD5Q8TDI0 1954 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 UNC79Q9P2D8 2635 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 M0QYV0 167 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEURL4Q96JN8 1562 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 C21orf140B9A014 251 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 PMP2P02689 132 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 TUBG1P23258 451 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCAP31P51572 246 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 DAOAP59103 153 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFA5Q16718 116 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM27BQ5VT28 67 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAHD1Q6P587 224 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 BAP18Q8IXM2 172 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACBD4Q8NC06 268 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 SGMS2Q8NHU3 365 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM45AQ8TCE6 357 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 TUBG2Q9NRH3 451 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX10Q9Y5X0 201 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 KIF24Q5T7B8 1368 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A087WUU8 490 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 FABP7O15540 132 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 HYPMO75409 117 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR10J1P30954 320 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRS3P32247 399 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 BTN3A2P78410 334 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKR1C1Q04828 323 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF846Q147U1 533 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACSM3Q53FZ2 586 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLEC2AQ6UVW9 174 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 PID1Q7Z2X4 250 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACY3Q96HD9 319 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR51B6Q9H340 312 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 HMCN2Q8NDA2 5059 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 GOLGA8IPA6NC78 632 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC169A6NNP5 214 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 M0R2N4 97 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 AKR7A2O43488 359 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRMP19623 302 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF345Q14585 488 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 ASCL4Q6XD76 172 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRC34Q8IZ02 419 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACOT12Q8WYK0 555 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRAP2Q96G30 205 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 SYT4Q9H2B2 425 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAPPC2LH3BP13 241 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDIPTO14735 213 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANXA8P13928 327 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 MSNP26038 577 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 DEKP35659 375 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBPL1P62380 186 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 HIKESHIQ53FT3 197 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 CAVIN4Q5BKX8 364 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 ANXA8L1Q5VT79 327 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 GKN2Q86XP6 184 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 C10orf67Q8IYJ2 551 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR5P2Q8WZ92 322 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 CMTM5Q96DZ9 223 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 PRRT1Q99946 306 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMBIM4Q9HC24 238 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD300AQ9UGN4 299 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCM3APO60318 1980 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 EFCAB9A8MZ26 197 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRASO14807 208 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 TFPTP0C1Z6 253 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 HERVK_113P63121 156 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 BEX3Q00994 111 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUP160Q12769 1436 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-277P-201ENST00000516272 FUOMA2VDF0 154 aa-1□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms