RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM122AQ96E09 287 aa5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FAM173AQ9BQD7 235 aa5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC25A22Q9H936 323 aa5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SIRT7Q9NRC8 400 aa5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R2P9O14990 202 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLDN1O95832 211 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TUBG1P23258 451 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 APLNRP35414 380 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BRWD1-AS2P59051 145 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR8G1Q15617 311 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NRN1LQ496H8 165 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR52L2PQ8NGH6 319 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR2J1Q9GZK6 312 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 USF3Q68DE3 2245 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C9orf118A6NHY6 69 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLDN34H7C241 214 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IFNL4K9M1U5 179 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGHEP01854 428 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COX5BP10606 129 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EGR1P18146 543 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 S100GP29377 79 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARR3P36575 388 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PMP22Q01453 160 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TFF3Q07654 80 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC38A11Q08AI6 406 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMEM41BQ5BJD5 291 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ABHD17BQ5VST6 288 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPPA3Q6W0C5 159 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 Q6ZR03 302 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR4X1Q8NH49 305 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LHX4Q969G2 390 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL17BQ9UHF5 180 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.49□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR5H1A6NKK0 313 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C17orf98A8MV24 154 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 B4E171 279 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NXPH2O95156 264 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SLC25A6P12236 298 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TSPAN7P41732 249 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR3A1P47881 315 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RND2P52198 227 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AESQ08117 197 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 P2RY6Q15077 328 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PIP4P1Q86T03 277 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MCEMP1Q8IX19 187 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 S100PBPQ96BU1 408 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TREM2Q9NZC2 230 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 VAX2Q9UIW0 290 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FZR1Q9UM11 496 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GAB2Q9UQC2 676 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR5B21A6NL26 309 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 J3QT63 122 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZG16O60844 167 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 S1PR2O95136 353 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 COL10A1Q03692 680 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TNFRSF9Q07011 255 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GCSAMLQ5JQS6 135 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RFESDQ8TAC1 157 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C14orf144Q96I85 54 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPRY4Q9C004 299 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 OR2D2Q9H210 308 aa5.48□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 B4DEV8 164 aa5.47□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 B9A039 149 aa5.47□□□□□ -1.53
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LYZL6O75951 148 aa5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms