RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 AKIP1Q9NQ31 210 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 FKBP14Q9NWM8 211 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SCN3BQ9NY72 215 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 CKLFQ9UBR5 152 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 ZNF221Q9UK13 617 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 TPRKBQ9Y3C4 175 aa4.57□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 PPP5D1E7EU14 171 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 PTGES3LE9PB15 166 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SC5DO75845 299 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 ACTL6BO94805 426 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 OR2C1O95371 312 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 GLAP06280 429 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 CDK1P06493 297 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SCTP09683 121 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 LIMS3P0CW19 117 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 LIMS4P0CW20 117 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MYL12AP19105 171 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 EDN2P20800 178 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 CRHBPP24387 322 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 ARL3P36405 182 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MFAP2P55001 183 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 PJVKQ0ZLH3 352 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 HMGN3Q15651 99 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 TNXAQ16473 311 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 C15orf32Q32M92 178 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 AWAT2Q6E213 333 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SYS1Q8N2H4 156 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 OR2C3Q8N628 320 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 NECAP1Q8NC96 275 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SETD6Q8TBK2 473 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 FAM46BQ96A09 425 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 NEDD4LQ96PU5 975 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SELENOIQ9C0D9 397 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 DUSP21Q9H596 190 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 BATF3Q9NR55 127 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MLXQ9UH92 298 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 UBQLN2Q9UHD9 624 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.56□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 TMEM213A2RRL7 107 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 A8MWP6 167 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 E9PI62 339 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 M0R1X1 148 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 M0R2N4 97 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 ITGB1BP1O14713 200 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SHOXO15266 292 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 RGS10O43665 173 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 PDCD6O75340 191 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 PRH1P02810 166 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MGMTP16455 207 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 RTL8BQ17RB0 113 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 OR2G6Q5TZ20 316 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MOB1BQ7L9L4 216 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A42Q86VD7 318 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 ZNF575Q86XF7 245 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 GPHB5Q86YW7 130 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 JAGN1Q8N5M9 183 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 NANOGP1Q8N7R0 232 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 ZNF383Q8NA42 475 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 ACOT12Q8WYK0 555 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MUL1Q969V5 352 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MARC2Q969Z3 335 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 GALNT14Q96FL9 552 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SPIN2AQ99865 258 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 BANF2Q9H503 90 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 BABAM2Q9NXR7 383 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 CLEC2DQ9UHP7 191 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 APLNQ9ULZ1 77 aa4.55□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 DPPA5A6NC42 116 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MPTX1A8MV57 137 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 MYL12BO14950 172 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 RTL8CO15255 209 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 OR2J3O76001 311 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 P0DMU3 169 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 FAM231AP0DMU4 169 aa4.54□□□□□ -1.68
CBX1-205ENST00000495350 FAM231CP0DMU5 169 aa4.54□□□□□ -1.68
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