RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 PMELP40967 661 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 HAAOP46952 286 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 GABRA2P47869 451 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 FUT6P51993 359 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ATP1B3P54709 279 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 TAS2R46P59540 309 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 DEFA5Q01523 94 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ZNF154Q13106 437 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 FAM76BQ5HYJ3 339 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 FAM201AQ5SY85 155 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 LCE1FQ5T754 118 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 UQCC3Q6UW78 93 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 WDR82Q6UXN9 313 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 LYG2Q86SG7 212 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 MKXQ8IYA7 352 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 OR4K15Q8NH41 348 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 CASTOR1Q8WTX7 329 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 DCUN1D4Q92564 292 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 SEH1LQ96EE3 360 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 GFI1Q99684 422 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 SLC6A7Q99884 636 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 GPR173Q9NS66 373 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 DCAF16Q9NXF7 216 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 GHRLQ9UBU3 117 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 PRELID1Q9Y255 219 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 AUP1Q9Y679 476 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 V9GYS6 101 aa3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 HIVEP2P31629 2446 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 A0A1B0GTI1 187 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 TMEM235A6NFC5 223 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 A8MXK9 166 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 SRRM5B3KS81 715 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 J3QT63 122 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 DVL1O14640 695 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 TCF21O43680 179 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ENSAO43768 121 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 NXPH2O95156 264 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 LHBP01229 141 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 IGLV3-1P01715 115 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 APOC3P02656 99 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 PMP2P02689 132 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 CCL1P22362 96 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ANOS1P23352 680 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 MPZP25189 248 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 PSMB6P28072 239 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 CFHR2P36980 270 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 RBMXP38159 391 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 RBP2P50120 134 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 EFNB2P52799 333 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 MTCP1P56278 107 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 DHRS2Q13268 280 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 BTN1A1Q13410 526 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ZNF345Q14585 488 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 IL17RELQ6ZVW7 336 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 Q8IYB0 196 aa3.68□□□□□ -1.82
RBM39-240ENST00000495293 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms