RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CD300LBA8K4G0 201 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 NRASP01111 189 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CSN2P05814 226 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PF4V1P10720 104 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ESDP10768 282 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CEACAM3P40198 252 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CKS1BP61024 79 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 SRPXP78539 464 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 NICN1Q9BSH3 213 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 NGBQ9NPG2 151 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 VSIG4Q9Y279 399 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 J3QR06 171 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R1B8 84 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CRYAAP02489 173 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CTRLP40313 264 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF83P51522 516 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FUT6P51993 359 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 TPPP2P59282 170 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 BAXQ07812 192 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZN92 141 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 AQP3Q92482 292 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 KIAA1456Q9P272 454 aa6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 HCFC1P51610 2035 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 GAGE12BA1L429 117 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 NKX2-6A6NCS4 301 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 PRH1P02810 166 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLC2P0DOY2 106 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLC3P0DOY3 106 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 KITLGP21583 273 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 KISS1Q15726 138 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8S1Q8NH09 359 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 CST11Q9H112 138 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXL17Q9UF56 701 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 ATMQ13315 3056 aa6.09□□□□□ -1.43
SMARCE1-211ENST00000493660 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM17P0DL12 118 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CD40P25942 277 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GLRXP35754 106 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GUCA2AQ02747 115 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PLCXD3Q63HM9 321 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 NUP37Q8NFH4 326 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNG8Q8WXS5 425 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PIGCQ92535 297 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 BORCS8Q96FH0 119 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SFRP2Q96HF1 295 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 C2orf50Q96LR7 162 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 GPER1Q99527 375 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 SIGMAR1Q99720 223 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 RARRES2Q99969 163 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.09□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 LAMA5O15230 3695 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 POLEQ07864 2286 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 OR11H12B2RN74 326 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 K7N7A8 449 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 HYPMO75409 117 aa6.08□□□□□ -1.44
SMARCE1-211ENST00000493660 TSPAN13O95857 204 aa6.08□□□□□ -1.44
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