RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	YPEL2	Q96QA6	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXC2	Q99958	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUDT15	Q9NV35	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PRD5	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PRF3	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PRM7	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DIRAS3	O95661	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRTN3	P24158	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX7A1	P24310	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	NFYB	P25208	207 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD34	P28906	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNG10	P50151	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	AP3S2	P59780	193 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD300C	Q08708	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF585B	Q52M93	769 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CADM3	Q8N126	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DRAM1	Q8N682	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0G2JRQ6	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		J3QR06	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R1W7	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGB1BP1	O14713	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSD17B6	O14756	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPINT2	O43291	252 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFSF12	O43508	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LIPF	P07098	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MSMB	P08118	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTXN2	P0C2S0	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CT45A6	P0DMU7	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CT45A5	P0DMU8	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CT45A7	P0DMV0	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	INPP1	P49441	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFA1	P59665	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFA3	P59666	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPAN5	P62079	268 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM16L	Q309B1	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SP6	Q3SY56	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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