RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489554.1

SCAMP4-208, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SCAMP4, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-208ENST00000489554 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 COQ8AQ8NI60 647 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 MOB3AQ96BX8 217 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 PSG11Q9UQ72 335 aa8.48□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 A0A1W2PPE3 182 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 A6NDX4 124 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 CHST1O43916 411 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 HLA-GP17693 338 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 NFYBP25208 207 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ARHGDIBP52566 201 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF767PQ75MW2 155 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 LINC00311Q8N616 119 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR4P4Q8NGL7 312 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 MITD1Q8WV92 249 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 RAB9BQ9NP90 201 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 COMMD9Q9P000 198 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 DPM3Q9P2X0 92 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 GNG12Q9UBI6 72 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 GPR132Q9UNW8 380 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 VSIG4Q9Y279 399 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 HILPDAQ9Y5L2 63 aa8.47□□□□□ -1.05
SCAMP4-208ENST00000489554 C9orf170A2RU37 121 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 HMSDA8MTL9 139 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 LEUTXA8MZ59 168 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 J3QR06 171 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 ST8SIA5O15466 376 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 HSPA12AO43301 675 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 S100GP29377 79 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 CEACAM3P40198 252 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 GNG10P50151 68 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 RAB13P51153 203 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 UCP3P55916 312 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 DHODHQ02127 395 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 C2orf68Q2NKX9 166 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 Q8N2B8 174 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa8.46□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 LY6LH3BQJ8 138 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 GOSR2O14653 212 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 TOR1AO14656 332 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 OR8U9P0C7N5 309 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 PGAM2P15259 253 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 CXCL3P19876 107 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 GNRHRP30968 328 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 BRS3P32247 399 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF137PP52743 207 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 PRRX1P54821 245 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 FXYD4P59646 89 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 DHRS2Q13268 280 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 TMEM219Q86XT9 240 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 OR8U1Q8NH10 309 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 OR9G1Q8NH87 305 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 TMEM230Q96A57 120 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 ABHD14BQ96IU4 210 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 ZNF702PQ9H963 129 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 HSPB11Q9Y547 144 aa8.45□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 OOSP1A8MZH6 123 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 SFT2D2O95562 160 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 AKR1C4P17516 323 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 PI3P19957 117 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 VAMP1P23763 118 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 HERV-K104P61576 105 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 MSMO1Q15800 293 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.44□□□□□ -1.06
SCAMP4-208ENST00000489554 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.44□□□□□ -1.06
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