RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PRD5 423 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PRF3 423 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PRM7 423 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 A6NJ64 397 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SERPINE3A8MV23 424 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf77C9JDV5 145 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GABARAPH6UMI1 98 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BET1O15155 118 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 RBBP9O75884 186 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 NAPSAO96009 420 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 MELTFP08582 738 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FCGR3AP08637 254 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IL7P13232 177 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SLC25A16P16260 332 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 NFYBP25208 207 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CD40LGP29965 261 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF45Q02386 682 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GNMTQ14749 295 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C14orf177Q52M58 125 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 METTL11BQ5VVY1 283 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TRIQKQ629K1 86 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FAM219AQ8IW50 185 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 BEST4Q8NFU0 473 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR4D10Q8NGI6 311 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 S100ZQ8WXG8 99 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 LEAP2Q969E1 77 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ARL11Q969Q4 196 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 MOB3AQ96BX8 217 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FOXC2Q99958 501 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 DNTTIP1Q9H147 329 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNRD1Q9P1U0 126 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ONECUT1Q9UBC0 465 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 DSCAML1Q8TD84 2053 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PPQ1 181 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 hADV38S2A0JD32 116 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FUOMA2VDF0 154 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TRDCB7Z8K6 153 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C15orf65H3BRN8 121 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CTDSPLO15194 276 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SLC31A2O15432 143 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PLA2G10O15496 165 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FABP7O15540 132 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FSTL3O95633 263 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TGFAP01135 160 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 HBZP02008 142 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CD3DP04234 171 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GLAP06280 429 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FAM106CPP0CH98 169 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF728P0DKX0 622 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CGB3P0DN86 165 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CGB7P0DN87 165 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 COX7A1P24310 79 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PAX6P26367 422 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ERP29P30040 261 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 HRH1P35367 487 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 KCNJ3P48549 501 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 INPP1P49441 399 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GNG10P50151 68 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 DLX6P56179 175 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ARPC4P59998 168 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 HLA-DRB3P79483 266 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GAGE5Q13069 117 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GAGE6Q13070 117 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 KLRD1Q13241 179 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 HERPUD1Q15011 391 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ARL6IP1Q15041 203 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF876PQ49A33 203 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 LCE1FQ5T754 118 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF880Q6PDB4 577 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C16orf87Q6PH81 154 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 HOGA1Q86XE5 327 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GAPTQ8N292 157 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 PNKDQ8N490 385 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.8□□□□□ -1.8
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