RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 SSMEM1Q8WWF3 244 aa10.49□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 IL22RA2Q969J5 263 aa10.49□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.49□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 TMEM222Q9H0R3 208 aa10.49□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 FLVCR2Q9UPI3 526 aa10.49□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 HIVEP2P31629 2446 aa10.49□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 A0A0B4J2A0 478 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 C9orf170A2RU37 121 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 SNRPGP15A8MWD9 76 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 H7C2Y5 167 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 FCGR3BO75015 233 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 SPDEFO95238 335 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 MOSP00540 346 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 HRASP01112 189 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 FAM157CP0CG43 387 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 VAMP1P23763 118 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
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NISCH-208ENST00000481211 PPP1R1AQ13522 171 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 LRTM2Q8N967 370 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 TMEM56Q96MV1 263 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 SSX3Q99909 188 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 C1RLQ9NZP8 487 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 SHPKQ9UHJ6 478 aa10.48□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa10.48□□□□□ -0.73
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NISCH-208ENST00000481211 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 CRLF1O75462 422 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 CDS2O95674 445 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 IGKV1D-33P01593 117 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 IGKV1-33P01594 117 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 OR5AC1P0C628 307 aa10.47□□□□□ -0.73
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NISCH-208ENST00000481211 IER3P46695 156 aa10.47□□□□□ -0.73
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NISCH-208ENST00000481211 POU2AF1Q16633 256 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 IL17RELQ6ZVW7 336 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 LGI3Q8N145 548 aa10.47□□□□□ -0.73
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NISCH-208ENST00000481211 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 CAPSLQ8WWF8 208 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 JMJD8Q96S16 334 aa10.47□□□□□ -0.73
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NISCH-208ENST00000481211 A0A0A6YYJ9 748 aa10.46□□□□□ -0.73
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NISCH-208ENST00000481211 M0QZK8 103 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 SHOXO15266 292 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 CRYZL1O95825 349 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 IGKV1-16P04430 117 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 FGF2P09038 288 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.46□□□□□ -0.73
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NISCH-208ENST00000481211 ERVK-16P61578 105 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 HES1Q14469 280 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 FAM219AQ8IW50 185 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 Q8N6K4 173 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 VSTM2AQ8TAG5 236 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 MITD1Q8WV92 249 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 HARBI1Q96MB7 349 aa10.46□□□□□ -0.73
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NISCH-208ENST00000481211 TCF19Q9Y242 345 aa10.46□□□□□ -0.73
NISCH-208ENST00000481211 HIVEP1P15822 2718 aa10.45□□□□□ -0.74
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NISCH-208ENST00000481211 H3BUX3 64 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RAMP3O60896 148 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 OR2F2O95006 317 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 TMEM11P17152 192 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 LPAR6P43657 344 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 BRWD1-AS2P59051 145 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 LINC00205P59089 165 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 RPS16P62249 146 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 TATDN3Q17R31 274 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 VMA21Q3ZAQ7 101 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 ZNF585BQ52M93 769 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 ZNF695Q8IW36 515 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 NPBQ8NG41 125 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 PIFOQ8TCI5 191 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-208ENST00000481211 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.45□□□□□ -0.74
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