RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TAAR6Q96RI8 345 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ODAMA1E959 279 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 C21orf140B9A014 251 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 VENTXO95231 258 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 GRPP07492 148 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SP1P08047 785 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ERVS71-1P61550 626 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 COL10A1Q03692 680 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 IGFBP7Q16270 282 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 OR1L1Q8NH94 360 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 BTF3L4Q96K17 158 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 CLN8Q9UBY8 286 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 WASF3Q9UPY6 502 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 CLDN14O95500 239 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 GYPAP02724 150 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TGFBR3Q03167 851 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 HNF4GQ14541 408 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 DCAF10Q5QP82 559 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SSX9Q7RTT3 188 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.3□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 C14orf144Q96I85 54 aa7.3□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 MARCH11A6NNE9 402 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 C12orf77C9JDV5 145 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SOX15O60248 233 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 S1PR2O95136 353 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 P0C879 139 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 PCSK5Q92824 1860 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 A0A1W2PPQ1 181 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 C9orf172C9J069 976 aa7.29□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PAGE4O60829 102 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 HBZP02008 142 aa7.29□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 ZG16O60844 167 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 GCGP01275 180 aa7.28□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 GNB2P62879 340 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TFF3Q07654 80 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 VWC2Q2TAL6 325 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 VCX2Q9H322 139 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 C17orf98A8MV24 154 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 C11orf94C9JXX5 98 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PDE6DO43924 150 aa7.28□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 MPLP40238 635 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TMEM18Q96B42 140 aa7.28□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 HINT2Q9BX68 163 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.28□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 PSPNO60542 156 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 TYMSP04818 313 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 GZMHP20718 246 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 ARL3P36405 182 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 GABRA2P47869 451 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 AESQ08117 197 aa7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PKP4-210ENST00000480171 ZNF766Q5HY98 468 aa7.27□□□□□ -1.25
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