RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 IGHG4P01861 327 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 TCRBP04435 133 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 IGF1P05019 195 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 OR5H8P0DN80 308 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 CFHR3Q02985 330 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 DEFB136Q30KP8 78 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 LY6G6FQ5SQ64 297 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 C6orf201Q7Z4U5 140 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 NABP2Q9BQ15 211 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 IFT46Q9NQC8 304 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 MCUBQ9NWR8 336 aa11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 SSX5O60225 188 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 DHFRP00374 187 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 OR3A3P47888 321 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 ARFRP1Q13795 201 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 MEF2DQ14814 521 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 STEAP1BQ6NZ63 245 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF251Q9BRH9 671 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF580Q9UK33 172 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 ANAPC10Q9UM13 185 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 KCNK7Q9Y2U2 307 aa11.22□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 NBR2O15453 112 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 RAB3DO95716 219 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 NAPSAO96009 420 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 CD74P04233 296 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 CD3DP04234 171 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 NAT1P18440 290 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 TBPP20226 339 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 CCR6P51684 374 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 KIR2DS1Q14954 304 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 FAM71F2Q6NXP2 309 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 IFI27L2Q9H2X8 130 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 PARP11Q9NR21 331 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 NUDT15Q9NV35 164 aa11.21□□□□□ -0.61
ATG4B-218ENST00000479554 ATP6V0E1O15342 81 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 ST8SIA5O15466 376 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 HLA-DRB1P01911 266 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 CNTFRP26992 372 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 PSMB8P28062 276 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 CD69Q07108 199 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 TATDN3Q17R31 274 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 ACTBL2Q562R1 376 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 OR51J1Q9H342 316 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 PIPOXQ9P0Z9 390 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 KIAA1456Q9P272 454 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 SLC23A1Q9UHI7 598 aa11.2□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 DISC1C4P0D8 188 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 RAB29O14966 203 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 HLA-DMAP28067 261 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 C5orf64Q2M2E5 130 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 C9orf66Q5T8R8 295 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM65Q6PI78 240 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 HOGA1Q86XE5 327 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 RITA1Q96K30 269 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 NEURL2Q9BR09 285 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 AK3Q9UIJ7 227 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 ALG5Q9Y673 324 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 WSB1Q9Y6I7 421 aa11.19□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 A0A0B4J293 547 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 HMX3A6NHT5 357 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 G3V318 75 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 M0QYG6 137 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 RAMP3O60896 148 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 NDUFB6O95139 128 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 NDUFA3O95167 84 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 FCER2P06734 321 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 DTYMKP23919 212 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 HLA-DRB3P79483 266 aa11.18□□□□□ -0.62
ATG4B-218ENST00000479554 FHL3Q13643 280 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms