RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.16□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 A0A1B0GU03 582 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 A0A1B0GWJ7 208 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 WRBO00258 174 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 CDIPTO14735 213 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 MLNRO43193 412 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 RHBDL1O75783 438 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 ATG12O94817 140 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 HAND1O96004 215 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 SERPINE2P07093 398 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 CD55P08174 381 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 F2RP25116 425 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 F2RL1P55085 397 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 VAMP2P63027 116 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 PAX5Q02548 391 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 HMGN3Q15651 99 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 Q6ZPA2 131 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 OR11L1Q8NGX0 322 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 OR10Z1Q8NGY1 313 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 TMED6Q8WW62 240 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 CYYR1Q96J86 154 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 DUX5Q96PT3 197 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 TP53RKQ96S44 253 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 TOLLIPQ9H0E2 274 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 ARV1Q9H2C2 271 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 GCM1Q9NP62 436 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 RAB9BQ9NP90 201 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 OR2S2Q9NQN1 319 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 PARP11Q9NR21 331 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 FBXL17Q9UF56 701 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
MITF-215ENST00000478490 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 OOEPA6NGQ2 149 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 TMEM178BH3BS89 294 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 HSPB6O14558 160 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 HSD17B6O14756 317 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 HSPA12AO43301 675 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 ADH4P08319 380 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 TNFRSF1AP19438 455 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 NMSQ5H8A3 153 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 WDR86Q86TI4 376 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 BATF2Q8N1L9 274 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 SVBPQ8N300 66 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 DEFB108BQ8NET1 73 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 ZNF488Q96MN9 340 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 DIRC2Q96SL1 478 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 GINS3Q9BRX5 216 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 ESM1Q9NQ30 184 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 IL19Q9UHD0 177 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 TMEM218A2RU14 115 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 UMAD1C9J7I0 102 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 TRIM77I1YAP6 450 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 SIRPB1O00241 398 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 PITX3O75364 302 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 DFFBO76075 338 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 GRPP07492 148 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 CFHR2P36980 270 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 CAV2P51636 162 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 ID3Q02535 119 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 CATR1Q13166 79 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 FAM209BQ5JX69 171 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 C12orf54Q6X4T0 127 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.14□□□□□ -1.59
MITF-215ENST00000478490 FAM219AQ8IW50 185 aa5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms