RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478075.1

CALD1-218, Transcript of caldesmon 1, humanhuman

TSL 3

Gene CALD1, Length 193 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1-218ENST00000478075 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 RAD51CO43502 376 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SULT1B1O43704 296 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SLC16A7O60669 478 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 ZMPSTE24O75844 475 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 UBL3O95164 117 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 LSM8O95777 96 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 MT1EP04732 61 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 SSR4P51571 173 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 OR4D1Q15615 310 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 PPM1LQ5SGD2 360 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 C1orf194Q5T5A4 169 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 XAF1Q6GPH4 301 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SLC25A24Q6NUK1 477 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 LCN15Q6UWW0 184 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 WDR82Q6UXN9 313 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 TPGS1Q6ZTW0 290 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 RAB43Q86YS6 212 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 CBLN2Q8IUK8 224 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 Q8IYB0 196 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 OR10Z1Q8NGY1 313 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 OR6K3Q8NGY3 331 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 GPR151Q8TDV0 419 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 TMEM239Q8WW34 195 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 SGTBQ96EQ0 304 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 DYNLL2Q96FJ2 89 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 FAM19A4Q96LR4 140 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 LYSMD1Q96S90 227 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 NMNAT3Q96T66 252 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 TMEM147Q9BVK8 224 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 BPESC1Q9GZL8 116 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 ELOVL3Q9HB03 270 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 TUBG2Q9NRH3 451 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-1.09□□□□□ -2.58
CALD1-218ENST00000478075 FREM3P0C091 2139 aa-1.09□□□□□ -2.58
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CALD1-218ENST00000478075 AGTP01019 485 aa-1.1□□□□□ -2.59
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CALD1-218ENST00000478075 MBP02144 154 aa-1.1□□□□□ -2.59
CALD1-218ENST00000478075 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.1□□□□□ -2.59
CALD1-218ENST00000478075 MSMBP08118 114 aa-1.1□□□□□ -2.59
CALD1-218ENST00000478075 TFPTP0C1Z6 253 aa-1.1□□□□□ -2.59
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