RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 NEURL2Q9BR09 285 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 S4R3C0 116 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-209ENST00000473257 A0A075B6Q4 140 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 H3BUA1 57 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SLC17A2O00624 439 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SHOXO15266 292 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FABP7O15540 132 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 CDK1P06493 297 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 LGALS7P47929 136 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SPHARQ15513 63 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MED22Q15528 200 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 PRSS8Q16651 343 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 HES5Q5TA89 166 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 Q8N402 240 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 KMT2AQ03164 3969 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 HERC2O95714 4834 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 A0A0B4J203 849 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SHISA3A0PJX4 238 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 HMX3A6NHT5 357 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 LINC00473A8K010 186 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MPPED1O15442 326 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 JTBO76095 146 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 CRYZL1O95825 349 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FCGR3AP08637 254 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR9G9P0C7N8 305 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 HSMCR30P0CW71 290 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 GNB3P16520 340 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 AADACP22760 399 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 GUCA2BQ16661 112 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TMEM177Q53S58 311 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 PACRGLQ8N7B6 248 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 THRSPQ92748 146 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MND1Q9BWT6 205 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 HSF4Q9ULV5 492 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR2J3O76001 311 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TPPPO94811 219 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR2A4O95047 310 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR2C1O95371 312 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MAP2K4P45985 399 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR10A3P58181 314 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 ATP5G2Q06055 141 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SNAPC3Q92966 411 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 USMG5Q96IX5 58 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 C2orf70A6NJV1 201 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR11H12B2RN74 326 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 DENRO43583 198 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FOLR2P14207 255 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MYOD1P15172 320 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 UBE2KP61086 200 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FABP5Q01469 135 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.066e-17■■■□□ 16.2
ACTB-209ENST00000473257 IRF3Q14653 427 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TATDN3Q17R31 274 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 RTL8BQ17RB0 113 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 DDB2Q92466 427 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 UFD1Q92890 307 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 RAB3CQ96E17 227 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 GPHA2Q96T91 129 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
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