RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 PAFAH1B2P68402 229 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 C5orf30Q96GV9 206 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 VAMP8Q9BV40 100 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 HSPB7Q9UBY9 170 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 SCO2A0A1W2PP80 73 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 LRP5LA4QPB2 252 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 KITLGP21583 273 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 OR2D2Q9H210 308 aa11.36□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 TCF21O43680 179 aa11.35□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 OR2H2O95918 312 aa11.35□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 BAGE2Q86Y30 109 aa11.35□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 SYNGR4O95473 234 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 LHX2P50458 406 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 PINLYPA6NC86 204 aa11.34□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.33□□□□□ -0.6
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SH3BP1-206ENST00000469947 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.32□□□□□ -0.6
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SH3BP1-206ENST00000469947 SH2D1BO14796 132 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 TIMP3P35625 211 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB7AP51149 207 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC35B1P78383 322 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 Q6ZVH6 145 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 OR1L6Q8NGR2 347 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 KCNE4Q8WWG9 221 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 PI4KAP42356 2102 aa11.32□□□□□ -0.6
SH3BP1-206ENST00000469947 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
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