RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TNFSF4P23510 183 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 THBS3P49746 956 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FABP6P51161 128 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ERVS71-1P61550 626 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RAB31Q13636 194 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ELOBQ15370 118 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ALKBH6Q3KRA9 238 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 Q3ZCU0 254 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MORN2Q502X0 79 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZS92 163 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR52L2PQ8NGH6 319 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR4A16Q8NH70 328 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C2CD4CQ8TF44 421 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 LRRC29Q8WV35 223 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 R3HDM4Q96D70 268 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GPHA2Q96T91 129 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 S1PR3Q99500 378 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RSG1Q9BU20 258 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SFXN3Q9BWM7 321 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 IL19Q9UHD0 177 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MED12LQ86YW9 2145 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ZFP92A6NM28 416 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MARCH11A6NNE9 402 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C17orf98A8MV24 154 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 F6UZH7 168 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 KBTBD11O94819 623 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 S1PR2O95136 353 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MT-CO2P00403 227 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 HRASP01112 189 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 LHBP01229 141 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CD99P14209 185 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FGF7P21781 194 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 S100A2P29034 98 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 G6PCP35575 357 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 AKR1C3P42330 323 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ARL16Q0P5N6 197 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 KLRB1Q12918 225 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 VWA1Q6PCB0 445 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 LCN15Q6UWW0 184 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZR03 302 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C5orf24Q7Z6I8 188 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ZFP82Q8N141 532 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR4S2Q8NH73 311 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MRGPRDQ8TDS7 321 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FAM222BQ8WU58 562 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ISOC2Q96AB3 205 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FAM210BQ96KR6 192 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR5B12Q96R08 314 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 IMMP2LQ96T52 175 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GNG12Q9UBI6 72 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MED13Q9UHV7 2174 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 TRAV39A0A0B4J263 110 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GV50 99 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 ZG16O60844 167 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 AGFG2O95081 481 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 CGB3P0DN86 165 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 CGB7P0DN87 165 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 DAOP14920 347 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 CD1BP29016 333 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 OPRK1P41145 380 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 B2MP61769 119 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 RPL30P62888 115 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 PMP22Q01453 160 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 FOXF2Q12947 444 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 ZNF726P1Q15940 193 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-208ENST00000464611 POU2AF1Q16633 256 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.2 ms