RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 HPRT1P00492 218 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 MOSP00540 346 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5AC1P0C628 307 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 LGALS7P47929 136 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00205P59089 165 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R1AQ13522 171 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 LYG2Q86SG7 212 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5R1Q8NH85 324 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 CFHR4Q92496 578 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TP53RKQ96S44 253 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SSX3Q99909 188 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 BEX1Q9HBH7 125 aa7.56□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRPGP15A8MWD9 76 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 INAFM1C9JVW0 142 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 CRYZL1O95825 349 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 HRASP01112 189 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV1D-33P01593 117 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV1-33P01594 117 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 UCP1P25874 307 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 PAX6P26367 422 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 LPAR6P43657 344 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 DHRS2Q13268 280 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 EBI3Q14213 229 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 HES1Q14469 280 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM187Q14656 261 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SP6Q3SY56 376 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM177Q53S58 311 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2B11Q5JQS5 317 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6YL49 198 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF695Q8IW36 515 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 LGI3Q8N145 548 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 COQ8AQ8NI60 647 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 GLYATL2Q8WU03 294 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 IL22RA2Q969J5 263 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 PHB2Q99623 299 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 COMMD9Q9P000 198 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 MAST4O15021 2626 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0B4J2A0 478 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SHOXO15266 292 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 RAMP3O60896 148 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 CRLF1O75462 422 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 CDS2O95674 445 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV1-16P04430 117 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM157CP0CG43 387 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 NQO2P16083 231 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM11P17152 192 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 IER3P46695 156 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 BRWD1-AS2P59051 145 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 ERVK-16P61578 105 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TATDN3Q17R31 274 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF585BQ52M93 769 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM86BQ8N661 226 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 MITD1Q8WV92 249 aa7.54□□□□□ -1.2
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SH3BP4-208ENST00000462602 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 HARBI1Q96MB7 349 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM56Q96MV1 263 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 C1RLQ9NZP8 487 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BUX3 64 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 S1PR2O95136 353 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SPDEFO95238 335 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 CD24P25063 80 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 HNF4GQ14541 408 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf82Q7Z2V1 217 aa7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SH3BP4-208ENST00000462602 CADM3Q8N126 398 aa7.53□□□□□ -1.2
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