RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	TSPAN5	P62079	268 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	CATR1	Q13166	79 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	IL18	Q14116	193 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	PLGLA	Q15195	96 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM17	Q86X19	198 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	OR4S2	Q8NH73	311 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	HARBI1	Q96MB7	349 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	SOST	Q9BQB4	213 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	OR51J1	Q9H342	316 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	KLK11	Q9UBX7	282 aa		11.54	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	SHOX	O15266	292 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV2-23	P01705	113 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	CD74	P04233	296 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	FCER2	P06734	321 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	CSF1	P09603	554 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	S100G	P29377	79 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	SLC6A1	P30531	599 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	TNFSF8	P32971	234 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	UCP3	P55916	312 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00205	P59089	165 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R19	P59542	299 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	FXYD4	P59646	89 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2K	P61086	200 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	TEX38	Q6PEX7	206 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	FBXL15	Q9H469	300 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		11.52	□□□□□ -0.56
PTPA-222	ENST00000445241		J3QRK9	145 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FCGR3B	O75015	233 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CRYZL1	O95825	349 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	IFNA6	P05013	189 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CRYGB	P07316	175 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ELANE	P08246	267 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CD28	P10747	220 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	VDAC1	P21796	283 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	GNRHR	P30968	328 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	DGCR2	P98153	550 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FOXE3	Q13461	319 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	MEF2D	Q14814	521 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	RNF152	Q8N8N0	203 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FABP12	A6NFH5	140 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	GPR31	O00270	319 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A17	O43808	307 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	IGHG4	P01861	327 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CD3D	P04234	171 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CX3CL1	P78423	397 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CFHR3	Q02985	330 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	POC5	Q8NA72	575 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM68	Q96MH6	324 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	LINC01548	A6NM66	108 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V0E1	O15342	81 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	HRAS	P01112	189 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FGF2	P09038	288 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ETV6	P41212	452 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ECI1	P42126	302 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	OR4F4	Q96R69	305 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		11.5	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	DPPA5	A6NC42	116 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	RAB3D	O95716	219 aa		11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
PTPA-222	ENST00000445241	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		11.49	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms