RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TEX38Q6PEX7 206 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 P2RX4Q99571 388 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 HRASLSQ9HDD0 168 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 MCUBQ9NWR8 336 aa9.19□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 CENPXA8MT69 81 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 LYRM1O43325 122 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 MOSP00540 346 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 AMY1AP04745 511 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 AMY2AP04746 511 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ASAH1Q13510 395 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 DYRK1AQ13627 763 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 CDK10Q15131 360 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 SLC35E3Q7Z769 313 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ZNF329Q86UD4 541 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 OR5AP2Q8NGF4 316 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 IFI27L2Q9H2X8 130 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 EHFQ9NZC4 300 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 RNF150Q9ULK6 438 aa9.18□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 RYR2Q92736 4967 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 CCL24O00175 119 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 AP4M1O00189 453 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 CD74P04233 296 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 IFNA6P05013 189 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 TBPP20226 339 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 CD1BP29016 333 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 RFX2P48378 723 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ZNF137PP52743 207 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 MEF2DQ14814 521 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 RPL39P5Q59GN2 51 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 IGSF11Q5DX21 431 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 MZT2BQ6NZ67 158 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZS49 121 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 MUC7Q8TAX7 377 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 EDARADDQ8WWZ3 215 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 S1PR3Q99500 378 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 GINS4Q9BRT9 223 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 PIPOXQ9P0Z9 390 aa9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 NAP1L6A6NFF2 107 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 DISC1C4P0D8 188 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 RAB29O14966 203 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 GPR12P47775 334 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 INSL3P51460 131 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 TSPAN5P62079 268 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 MMDQ15546 238 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 RGS21Q2M5E4 152 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ODF3L1Q8IXM7 274 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ENKURQ8TC29 256 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 NABP2Q9BQ15 211 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 RDH8Q9NYR8 311 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ZNF221Q9UK13 617 aa9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.16□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 H7C2Y5 167 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 IGHG2P01859 326 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ZNF735P0CB33 412 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 OR5H8P0DN80 308 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 BTCP35070 178 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ECI1P42126 302 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 CCR6P51684 374 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 F2RL1P55085 397 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 EBI3Q14213 229 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 LY6G6FQ5SQ64 297 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 CASC10Q5T4H9 136 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 TMEM17Q86X19 198 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 STPG2Q8N412 459 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 OR51S1Q8NGJ8 323 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 DEDD2Q8WXF8 326 aa9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
PRAME-210ENST00000442481 ZNF251Q9BRH9 671 aa9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms