RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SRXN1Q9BYN0 137 aa12.79□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LNP1A1A4G5 178 aa12.79□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GREM1O60565 184 aa12.79□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SAP25Q8TEE9 199 aa12.79□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM209BQ5JX69 171 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC25A34Q6PIV7 304 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MYO16Q9Y6X6 1858 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CSRP3P50461 194 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FXYD3Q14802 87 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 APCDD1LQ8NCL9 501 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PTGDSP41222 190 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CTHRC1Q96CG8 243 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SFRP2Q96HF1 295 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 J3QW42 95 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COX6A1P12074 109 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC01590Q5TEZ4 76 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WNT5BQ9H1J7 359 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa12.78□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPIPB13A6NJU9 1138 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPIPB4C9JG80 1138 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SRIP30626 198 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PLP1P60201 277 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CX3CL1P78423 397 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MESP2Q0VG99 397 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COPS9Q8WXC6 57 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GALNT14Q96FL9 552 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C10orf128Q5T292 105 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PARLQ9H300 379 aa12.77□□□□□ -0.36
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR10AG1Q8NH19 301 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H4GQ99525 98 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PIMREGQ9BSJ6 248 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM70Q9BUB7 260 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C17orf51A8MQB3 221 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HLA-DRB1P01911 266 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HIST1H2BAQ96A08 127 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00518Q8N0U6 118 aa12.77□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNHIT1O43257 154 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CRYBB3P26998 211 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC25A53Q5H9E4 307 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ARL17AQ8IVW1 177 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DNASE2BQ8WZ79 361 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GUCD1Q96NT3 240 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 C2orf83Q53S99 150 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF506Q5JVG8 444 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC25A45Q8N413 288 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM229AB2RXF0 380 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC25A17O43808 307 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ASPHD2Q6ICH7 369 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LAIR2Q6ISS4 152 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCSK4Q6UW60 755 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR51G1Q8NGK1 321 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM186Q96B77 213 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GON4LQ3T8J9 2241 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 URB1O60287 2271 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCF19Q9Y242 345 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa12.76□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRGC1P0CF51 173 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GFRA1P56159 465 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR5P3Q8WZ94 311 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 H7C2G1 150 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TFPI2P48307 235 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RRN3P1Q2M238 152 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCN4AP35499 1836 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PF4V1P10720 104 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RNFT1Q5M7Z0 435 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCF24Q7RTU0 167 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR4C13Q8NGP0 309 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GCHFRP30047 84 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB9AP51151 201 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR9G1Q8NH87 305 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ELOVL5Q9NYP7 299 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa12.75□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 VENTXO95231 258 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DOCK5Q9H7D0 1870 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NKX2-8O15522 239 aa12.74□□□□□ -0.37
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF708P17019 499 aa12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms