RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 METTL21EPA6NDL7 271 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM64CA6NLI5 447 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 RAB3BP20337 219 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 AADACP22760 399 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 PJVKQ0ZLH3 352 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 OR5T1Q8NG75 326 aa16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 A8MZ25 164 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 SHOXO15266 292 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 OVCH2Q7RTZ1 564 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 TEX45Q8NA69 505 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 BVESQ8NE79 360 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 GINS4Q9BRT9 223 aa16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 DTYMKP23919 212 aa16.06■□□□□ 0.16
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LIMS1-208ENST00000428064 UBE2KP61086 200 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF343Q6P1L6 599 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 IZUMO2Q6UXV1 221 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 MUC7Q8TAX7 377 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 MAFIPQ8WZ33 124 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 USMG5Q96IX5 58 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZMAT4Q9H898 229 aa16.06■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 TALDO1P37837 337 aa16.05■□□□□ 0.16
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LIMS1-208ENST00000428064 Q8N1Y9 231 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 OR9G4Q8NGQ1 327 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 CNBD2Q96M20 576 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 TM2D3Q9BRN9 247 aa16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 A0A075B6Q4 140 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 GABARAPL2P60520 117 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 DYRK1AQ13627 763 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ARFRP1Q13795 201 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS8Q16651 343 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 NR2C2APQ86WQ0 139 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 RSRP1Q9BUV0 290 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00473A8K010 186 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 CASC10Q5T4H9 136 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 IL34Q6ZMJ4 242 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 HAPLN4Q86UW8 402 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF645Q8N7E2 425 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 C19orf73Q9NVV2 129 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 COA4Q9NYJ1 87 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 RAB26Q9ULW5 256 aa16.03■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0B4J203 849 aa16.02■□□□□ 0.16
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LIMS1-208ENST00000428064 H0Y980 276 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 CRYZL1O95825 349 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 CTXN2P0C2S0 81 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 OR9G9P0C7N8 305 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 C22orf42Q6IC83 251 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 SGPP2Q8IWX5 399 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 PHB2Q99623 299 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.02■□□□□ 0.16
LIMS1-208ENST00000428064 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 MSGN1A6NI15 193 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 FAM223BA6NKX1 122 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SCGNO76038 276 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SLC22A5O76082 557 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CDK10Q15131 360 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 TNXAQ16473 311 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 TATDN3Q17R31 274 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2UQ5VVX9 321 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 HACD4Q5VWC8 232 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 FAM223AQ8IWN6 122 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CITED4Q96RK1 184 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 ATG5Q9H1Y0 275 aa16.01■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 NOTOA8MTQ0 251 aa16■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 OR2A4O95047 310 aa16■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DQB1P01920 261 aa16■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SYNJ2BPP57105 145 aa16■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 OR2W1Q9Y3N9 320 aa16■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 RYR2Q92736 4967 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CD36P16671 472 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 RPEL1Q2QD12 228 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 CDNFQ49AH0 187 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 IDO2Q6ZQW0 420 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD9Q7L273 389 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 MMD2Q8IY49 270 aa15.99■□□□□ 0.15
LIMS1-208ENST00000428064 ACOT12Q8WYK0 555 aa15.99■□□□□ 0.15
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