RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427187.6

VNN3-208, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VNN3, Length 1,214 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-208ENST00000427187 OR2D2Q9H210 308 aa6.46□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.46□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 RDH8Q9NYR8 311 aa6.46□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 DNAH2Q9P225 4427 aa6.46□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.46□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 ZNF320A2RRD8 509 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 FAM223BA6NKX1 122 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 SOCS1O15524 211 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 SPRY2O43597 315 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 MYL12AP19105 171 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CBLN1P23435 193 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 PRSS8Q16651 343 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 C15orf32Q32M92 178 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 BTNL8Q6UX41 500 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CDH26Q8IXH8 852 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 PTX4Q96A99 478 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TM2D1Q9BX74 207 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TMEM213A2RRL7 107 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 HMX3A6NHT5 357 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CIB2O75838 187 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 NDUFB8O95169 186 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CRYZL1O95825 349 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 BMI1P35226 326 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TMEM177Q53S58 311 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 UXS1Q8NBZ7 420 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TMEM80Q96HE8 168 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CCDC140Q96MF4 163 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 Q9N2K0 584 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 GHRLQ9UBU3 117 aa6.44□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 MUC4Q99102 2169 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 LGALS9O00182 355 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 BET1O15155 118 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 UBBP0CG47 229 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CTRB1P17538 263 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CELP19835 753 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 ARL3P36405 182 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 QRFPP83859 136 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CBX3Q13185 183 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 P2RY14Q15391 338 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 RTL8BQ17RB0 113 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 IGSF11Q5DX21 431 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 NECAP1Q8NC96 275 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 FBXL17Q9UF56 701 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.43□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 LINC00473A8K010 186 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TRDCB7Z8K6 153 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 J3QRK9 145 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 S1PR2O95136 353 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 SRMP19623 302 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 APOC4P55056 127 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TMEM50BP56557 158 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 UBE2KP61086 200 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 Q6ZWC4 215 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 TEX45Q8NA69 505 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 RNF183Q96D59 192 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.42□□□□□ -1.38
VNN3-208ENST00000427187 PECRQ9BY49 303 aa6.42□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms