RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6M1Q8NGM8 313 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USMG5Q96IX5 58 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HARBI1Q96MB7 349 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSC22D3Q99576 134 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COA4Q9NYJ1 87 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RDH8Q9NYR8 311 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa9.99□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRMP19623 302 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD81P60033 236 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B12Q53GQ0 312 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PEMTQ9UBM1 199 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSF4Q9ULV5 492 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTGES3LE9PB15 166 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD37P11049 281 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEDD8Q15843 81 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAX1Q8IWV1 398 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPARTQ8N0X7 666 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM89BQ8N5H3 189 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PHB2Q99623 299 aa9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A0B4J203 849 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPPPO94811 219 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APELAP0DMC3 54 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CBX3Q13185 183 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 P2RY14Q15391 338 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM177Q53S58 311 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNAPC3Q92966 411 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEURL2Q9BR09 285 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2D2Q9H210 308 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DUSP21Q9H596 190 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDHAF2Q9NX18 166 aa9.97□□□□□ -0.81
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRDCB7Z8K6 153 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SHOXO15266 292 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AIREO43918 545 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UCHL1P09936 223 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINB10P48595 397 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM50BP56557 158 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR4A4PQ8NGN8 299 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf30Q96GV9 206 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MND1Q9BWT6 205 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PECRQ9BY49 303 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLGRKTQ9HBL7 147 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A8Q9NY64 477 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.96□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMPR1BO00238 502 aa9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC17A2O00624 439 aa9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGS10O43665 173 aa9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOL3O60936 208 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR9G9P0C7N8 305 aa9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNXAQ16473 311 aa9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTL8BQ17RB0 113 aa9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GFI1Q99684 422 aa9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFDC10AQ9H1F0 79 aa9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MSGN1A6NI15 193 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM223BA6NKX1 122 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BET1O15155 118 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPPED1O15442 326 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FABP7O15540 132 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD7P09564 240 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD3GP09693 182 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRASP10301 218 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOGP84095 191 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS8Q16651 343 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLAC9Q5JTB6 97 aa9.94□□□□□ -0.82
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNLSQ5VYX0 342 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms