RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGF1P05019 195 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIR2DS2P43631 304 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UCP3P55916 312 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00205P59089 165 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DGCR2P98153 550 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CATR1Q13166 79 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CMTM1Q8IZ96 169 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFSD4AQ8N468 514 aa12.1□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4S2Q8NH73 311 aa12.1□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHOXO15266 292 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD3DP04234 171 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNTFRP26992 372 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100GP29377 79 aa12.09□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC35B1P78383 322 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MEF2DQ14814 521 aa12.09□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM95Q3KNT9 176 aa12.09□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXB2Q5VYV0 432 aa12.09□□□□□ -0.47
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa12.08□□□□□ -0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FXYD6Q9H0Q3 95 aa12.08□□□□□ -0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRYZL1O95825 349 aa12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF562Q6V9R5 426 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R27Q86WC6 154 aa12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX45Q8NA69 505 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POC5Q8NA72 575 aa12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEDD2Q8WXF8 326 aa12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR51J1Q9H342 316 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BATF3Q9NR55 127 aa12.07□□□□□ -0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 VDAC1P21796 283 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP3S2P59780 193 aa12.06□□□□□ -0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TERB2Q8NHR7 220 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VSTM2AQ8TAG5 236 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RSRP1Q9BUV0 290 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DISC1C4P0D8 188 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFSF12O43508 249 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HRASP01112 189 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CX3CL1P78423 397 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf68Q2NKX9 166 aa12.05□□□□□ -0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PYDC2Q56P42 97 aa12.05□□□□□ -0.48
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