RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 KIR2DS2P43631 304 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 LPAR6P43657 344 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 PAX9P55771 341 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 S100A10P60903 97 aa4.93□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 TMEM155Q4W5P6 130 aa4.93□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 NCR3LG1Q68D85 454 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF575Q86XF7 245 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 FGFRL1Q8N441 504 aa4.93□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 RAB1BQ9H0U4 201 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 COL6A6A6NMZ7 2263 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.93□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 DVL1O14640 695 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 TOR1AO14656 332 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 FGF16O43320 207 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 RAMP3O60896 148 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 ATG12O94817 140 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 SPDEFO95238 335 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 HPRT1P00492 218 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 RBP4P02753 201 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 NDUFB7P17568 137 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 OMGP23515 440 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 GPR12P47775 334 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF137PP52743 207 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM33P57088 247 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 TAS2R30P59541 319 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 POU2AF1Q16633 256 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 FAM71F2Q6NXP2 309 aa4.92□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 BAP18Q8IXM2 172 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 SPAG16Q8N0X2 631 aa4.92□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 STPG2Q8N412 459 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 OR2C3Q8N628 320 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 UBAC2Q8NBM4 344 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF714Q96N38 554 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 RAB40CQ96S21 281 aa4.92□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 CACNG5Q9UF02 275 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 WSB1Q9Y6I7 421 aa4.92□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.91□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 IGSF23A1L1A6 192 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 LEUTXA8MZ59 168 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 M0R1X1 148 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 CHST1O43916 411 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 JTBO76095 146 aa4.91□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 FAM157CP0CG43 387 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 RRASP10301 218 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 CCL3L1P16619 93 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 BTF3P20290 206 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 THBS3P49746 956 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 RAB14P61106 215 aa4.91□□□□□ -1.62
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C6orf48-208ENST00000395788 BAXQ07812 192 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 LTC4SQ16873 150 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 RPL39P5Q59GN2 51 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 BTNL3Q6UXE8 466 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF383Q8NA42 475 aa4.91□□□□□ -1.62
C6orf48-208ENST00000395788 LY6G5BQ8NDX9 201 aa4.91□□□□□ -1.62
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