RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 RPS16P62249 146 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 EDDM3AQ14507 147 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 DCTN5Q9BTE1 182 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 GZMHP20718 246 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00205P59089 165 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 BSXQ3C1V8 233 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 SPINK9Q5DT21 86 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 RAB24Q969Q5 203 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 PROCRQ9UNN8 238 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 DUTP33316 252 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 C16orf82Q7Z2V1 217 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 C15orf62A8K5M9 175 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 RPL23P62829 140 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 HIST3H2BBQ8N257 126 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 OR4F5Q8NH21 305 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 OR4F4Q96R69 305 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 PARLQ9H300 379 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 HCFC1P51610 2035 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 FRYQ5TBA9 3013 aa21.95■■□□□ 1.11
HOXD13-201ENST00000392539 AHRRA9YTQ3 701 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 HPRT1P00492 218 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PLA2G5P39877 138 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 P2RY6Q15077 328 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 LTC4SQ16873 150 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 AARDQ4LEZ3 155 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 FAM90A1Q86YD7 464 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 OR2Z1Q8NG97 314 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 JPT1Q9UK76 154 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 OR9G9P0C7N8 305 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PYY3Q5JQD4 70 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 FAM169BQ8N8A8 192 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PPP1R35Q8TAP8 253 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 DIRC2Q96SL1 478 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 OR6C3Q9NZP0 311 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PRR14LQ5THK1 2151 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 SRRM5B3KS81 715 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PHOX2AO14813 284 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 EGR1P18146 543 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 OR10A7Q8NGE5 316 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 GATAD1Q8WUU5 269 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 GNG12Q9UBI6 72 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 TNFSF13O75888 250 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 SOD3P08294 240 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 RPP30P78346 268 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 MORN2Q502X0 79 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 SNX22Q96L94 193 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 WDR83OSQ9Y284 106 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 MGST3O14880 152 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 YPEL1O60688 119 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 FCGR3BO75015 233 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PFN1P07737 140 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 STARD4Q96DR4 205 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 YPEL2Q96QA6 119 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PYGO2Q9BRQ0 406 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 SRD5A3Q9H8P0 318 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 SOX15O60248 233 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 CGAP01215 116 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 CR1LQ2VPA4 569 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 DNLZQ5SXM8 178 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PIP4P1Q86T03 277 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 OR10D4PQ8NGN7 298 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 GPR61Q9BZJ8 451 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 SMCO3A2RU48 225 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PAGE4O60829 102 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PROP1O75360 226 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 SPCS3P61009 180 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 GFI1BQ5VTD9 330 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 H7BYZ3 331 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 CD1BP29016 333 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 CFHR2P36980 270 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 OR4A16Q8NH70 328 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 OR5B12Q96R08 314 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 SLC25A15Q9Y619 301 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 TLE1Q04724 770 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 C4orf17Q53FE4 359 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 ASCL3Q9NQ33 180 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 DKK4Q9UBT3 224 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 M0R1X1 148 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 Q8N7P7 452 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 OR52E5Q8NH55 327 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 ANAPC16Q96DE5 110 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 DUSP13Q9UII6 198 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD13-201ENST00000392539 GALR1P47211 349 aa21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms