RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377027.1

C9orf85-202, Transcript of chromosome 9 open reading frame 85, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf85, Length 539 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85-202ENST00000377027 OR8U9P0C7N5 309 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 TPPP2P59282 170 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 LIPKQ5VXJ0 399 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 GLT8D1Q68CQ7 371 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 MOB1BQ7L9L4 216 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 THRSPQ92748 146 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 TMEM203Q969S6 136 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 MND1Q9BWT6 205 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 HSF4Q9ULV5 492 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 LRRC42Q9Y546 428 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 LCE6AA0A183 80 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 IZUMO1RA6ND01 250 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 A8MZ25 164 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 SPDEFO95238 335 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 TRGV3P03979 118 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 MC5RP33032 325 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 VEGFCP49767 419 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 KRTAP10-2P60368 255 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 PITPNAQ00169 270 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 DYRK1AQ13627 763 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 PLGLAQ15195 96 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 SPHARQ15513 63 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 MS4A15Q8N5U1 240 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 POC5Q8NA72 575 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 NRG4Q8WWG1 115 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 RNF5Q99942 180 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 C8orf4Q9NR00 106 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 RDH8Q9NYR8 311 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 PTGES3LE9PB15 166 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 EBAG9O00559 213 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 HSPA12AO43301 675 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 TFAP2AP05549 437 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 CPEP16870 476 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 EDN2P20800 178 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ZBTB25P24278 435 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 FABP5Q01469 135 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 TPBGQ13641 420 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 FXYD3Q14802 87 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 MED22Q15528 200 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 IGSF11Q5DX21 431 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 PDPNQ86YL7 162 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 OR5T1Q8NG75 326 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 MAFIPQ8WZ33 124 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 SDHAF2Q9NX18 166 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ANKRD65E5RJM6 399 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 M0R1X1 148 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 CSN3P07498 182 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 FCGR3AP08637 254 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 GSTT2P0CG29 244 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 GSTT2BP0CG30 244 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 APELAP0DMC3 54 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 LYL1P12980 280 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 ARSBP15848 533 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 AQP4P55087 323 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 DDB2Q92466 427 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 OR4C12Q96R67 309 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 OR2D2Q9H210 308 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 GHITMQ9H3K2 345 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 DUSP21Q9H596 190 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 RETNQ9HD89 108 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf85-202ENST00000377027 STUB1Q9UNE7 303 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms