RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 BTN3A2P78410 334 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 HPCAP84074 193 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMAGPQ0VAQ4 97 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLEC12BQ2HXU8 276 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC26Q2I0M4 334 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM45BPQ6NSW5 357 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR5AK3PQ8NH89 298 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 C19orf60Q96EN9 201 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 MROQ9BYG7 248 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM222Q9H0R3 208 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 METTL9Q9H1A3 318 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 MYOFQ9NZM1 2061 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-227P-201ENST00000362865 TECTAO75443 2155 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 DAPL1A0PJW8 107 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR6C6A6NF89 314 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF879B4DU55 563 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 F8W036 122 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 AZIN1O14977 448 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRPP02741 224 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINA7P05543 415 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00614P0C842 121 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEFA4P12838 97 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CXCL2P19875 107 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CXCL3P19876 107 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 F8A1P23610 371 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MIPP30301 263 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 AQP4P55087 323 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBPL1P62380 186 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 HOXC5Q00444 222 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNA13Q14344 377 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MOGQ16653 247 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 LYZL1Q6UWQ5 148 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 BOD1L2Q8IYS8 172 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 C15orf53Q8NAA6 179 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR13C8Q8NGS7 320 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR10D3Q8NH80 312 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF675Q8TD23 568 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC7A6Q92536 515 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MS4A6EQ96DS6 147 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 DOHHQ9BU89 302 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CST9LQ9H4G1 147 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf109Q9NX04 203 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABCC12Q96J65 1359 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLEQ07864 2286 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MEIKINA0A087WXM9 373 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMSDA8MTL9 139 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMLR1H3BR10 107 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MT-CO2P00403 227 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CA5AP35218 305 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 HADHBP55084 474 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPI1P60174 286 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLCXD2Q0VAA5 305 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLAMF1Q13291 335 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDK5R1Q15078 307 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MIAQ16674 131 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q1T7F1 81 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 HLA-DRB5Q30154 266 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 C7orf65Q6ZTY9 151 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPHB5Q86YW7 130 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 RBP7Q96R05 134 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 IMMP2LQ96T52 175 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MED10Q9BTT4 135 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAV1Q8NEY1 1877 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 SIPA1L1O43166 1804 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0D9SEW6 157 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 C9JCJ5 164 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 H7C2G1 150 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 K7ERQ8 282 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD79BP40259 229 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 FXYD7P58549 80 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 FABP5Q01469 135 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRLF3Q8IUI8 442 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 Q8N2B8 174 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR5L1Q8NGL2 311 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC37A2Q8TED4 501 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBD3L1Q8WWY6 194 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC45Q96CN5 670 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM109Q9BVC6 243 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR52A5Q9H2C5 316 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 TREM1Q9NP99 234 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-227P-201ENST00000362865 MED9Q9NWA0 146 aa0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms