RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 KLK15Q9H2R5 256 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CCL28Q9NRJ3 127 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ZFP57Q9NU63 452 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 NUDT19A8MXV4 375 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FAM25AB3EWG3 89 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FAM25CB3EWG5 89 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FAM25GB3EWG6 89 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SHOXO15266 292 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SOX15O60248 233 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RRASP10301 218 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 NAT1P18440 290 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RPL5P46777 297 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 LGALS7P47929 136 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RFX2P48378 723 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FXYD4P59646 89 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CBX3Q13185 183 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 MZT2AQ6P582 158 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 MINDY2Q8NBR6 621 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD5Q8WTS1 349 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 AP3S1Q92572 193 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 DUX3Q96PT4 197 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 EHFQ9NZC4 300 aa11.66□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 A0A1W2PN81 502 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TNFSF12O43508 249 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 FCGR3BO75015 233 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 SLC22A5O76082 557 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 IGLV1-40P01703 118 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PMP2P02689 132 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CHRNA7P36544 502 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 BRWD1-AS2P59051 145 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 DEFB136Q30KP8 78 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 OXLD1Q5BKU9 147 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF562Q6V9R5 426 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 IDO2Q6ZQW0 420 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 OVCH2Q7RTZ1 564 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R27Q86WC6 154 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM17Q86X19 198 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF695Q8IW36 515 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 MYOZ3Q8TDC0 251 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 CASTOR1Q8WTX7 329 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 GIMAP1Q8WWP7 306 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R8Q9NYW2 309 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa11.65□□□□□ -0.54
CSAG1-201ENST00000361211 WIPF1O43516 503 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 IGLL1P15814 213 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CD33P20138 364 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 HLA-DMAP28067 261 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TMBIM6P55061 237 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 GNB1P62873 340 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 FXYD3Q14802 87 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 BEAN1Q3B7T3 259 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 LYSMD2Q8IV50 215 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 LAX1Q8IWV1 398 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MFSD4AQ8N468 514 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 LFNGQ8NES3 379 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 WFDC9Q8NEX5 89 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 GRPEL2Q8TAA5 225 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ARPC1AQ92747 370 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 RAX2Q96IS3 184 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 GNB4Q9HAV0 340 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 EXTL2Q9UBQ6 330 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CTDSP2O14595 271 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 HRH1P35367 487 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2KP61086 200 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 DYRK1AQ13627 763 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 VMA21Q3ZAQ7 101 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF66Q6ZN08 573 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 OR5H2Q8NGV7 314 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 P2RX4Q99571 388 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 FXYD6Q9H0Q3 95 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SCPEP1Q9HB40 452 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ADAM30Q9UKF2 790 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 H3BMQ9 156 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 RAB9AP51151 201 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TAS2R46P59540 309 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms