RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352127.11

XRCC3-201, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XRCC3, Length 2,563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC3-201ENST00000352127 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PAGE4O60829 102 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 CLDN14O95500 239 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 IGHV2-70P01814 119 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 IGHG3P01860 377 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 FAM209BQ5JX69 171 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 Q8TCH9 128 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PARLQ9H300 379 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 B4DEV8 164 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 CRYAAP02489 173 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 S100A2P29034 98 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 GCH1P30793 250 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 RND2P52198 227 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 VHLLQ6RSH7 139 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 DEFB124Q8NES8 71 aa14.74□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 C15orf65H3BRN8 121 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 IFNA1P01562 189 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 COX5AP20674 150 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PRDX2P32119 198 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 UBE2G2P60604 165 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 R3HDM4Q96D70 268 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 P2RX4Q99571 388 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 GAB2Q9UQC2 676 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 SMCO3A2RU48 225 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 C15orf62A8K5M9 175 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 FABP4P15090 132 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 GZMHP20718 246 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 SMIM21Q3B7S5 101 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 OR51G1Q8NGK1 321 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 GNG12Q9UBI6 72 aa14.73□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 RAB29O14966 203 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 SOX15O60248 233 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF134P52741 427 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF383Q8NA42 475 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PPP1R2P9O14990 202 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 S100PP25815 95 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PSMB3P49720 205 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF83P51522 516 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 EDDM3BP56851 147 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 LOXL4Q96JB6 756 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 MEGF10Q96KG7 1140 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 NAT8Q9UHE5 227 aa14.72□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PLCE1Q9P212 2302 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 DSCAMO60469 2012 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PHOX2AO14813 284 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 SLC31A2O15432 143 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 NPPCP23582 126 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 GPR12P47775 334 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 TAAR6Q96RI8 345 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 ROS1P08922 2347 aa14.71□□□□□ -0.05
XRCC3-201ENST00000352127 M0R1X1 148 aa14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 TNFSF13O75888 250 aa14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 KBTBD11O94819 623 aa14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 KITLGP21583 273 aa14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 PRSS8Q16651 343 aa14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 BSXQ3C1V8 233 aa14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 Q8N7P7 452 aa14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 SDSLQ96GA7 329 aa14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 DKK4Q9UBT3 224 aa14.71□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 SPINT2O43291 252 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 DEFB109BQ30KR1 87 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 ZNF709Q8N972 641 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 PRR7Q8TB68 274 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 OR6C3Q9NZP0 311 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 SEC14L6B5MCN3 397 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 RRHO14718 337 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 OR4X1Q8NH49 305 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 STARD4Q96DR4 205 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 LURAP1Q96LR2 239 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 DERL1Q9BUN8 251 aa14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 ATP5G3P48201 142 aa14.69□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa14.69□□□□□ -0.06
XRCC3-201ENST00000352127 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms