RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC35E3Q7Z769 313 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 C15orf62A8K5M9 175 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 M0R1X1 148 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC31A2O15432 143 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 OR2C1O95371 312 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 HPRT1P00492 218 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV1-46P01743 117 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RPL35P42766 123 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RPL39P5Q59GN2 51 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF561Q8N587 486 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 OR10P1Q8NGE3 313 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GCM1Q9NP62 436 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 OR6C3Q9NZP0 311 aa17.18■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 CEBPZOSA8MTT3 80 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 CD40P25942 277 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 OR2B8PP59922 312 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TFF3Q07654 80 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 PMS2P11Q13670 270 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 STUMQ69YW2 141 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TVP23CQ96ET8 276 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 SDSLQ96GA7 329 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa17.17■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 FGF7P21781 194 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RPS16P62249 146 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TCF23Q7RTU1 214 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 DDB2Q92466 427 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 PLCE1Q9P212 2302 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 BSNQ9UPA5 3926 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 LAMA5O15230 3695 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1W2PPE3 182 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF727A8MUV8 499 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 ITGB1BP1O14713 200 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 IGHV3-7P01780 117 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 BMP5P22003 454 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GNB2P62879 340 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM180AQ6UWF9 173 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 HEPN1Q6WQI6 88 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF7Q9UBF6 113 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 IL19Q9UHD0 177 aa17.16■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 IFNA4P05014 189 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 AKR1D1P51857 326 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TDGF1P3P51864 188 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB11AP62491 216 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 HNF4GQ14541 408 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 MRGPRGQ86SM5 289 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 NPCDR1Q9BY65 106 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 C5orf52A6NGY3 159 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 Q8N7P7 452 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GAFA1Q96PS6 74 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 P2RX4Q99571 388 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GFOD1Q9NXC2 390 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 VAX2Q9UIW0 290 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 GAB2Q9UQC2 676 aa17.15■□□□□ 0.34
KCNQ1-202ENST00000335475 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 NUP37Q8NFH4 326 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM234AQ9H0X4 552 aa17.14■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 LEAP2Q969E1 77 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 LHX4Q969G2 390 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A22Q9H936 323 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 DYSFO75923 2080 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 SSX9Q7RTT3 188 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC39A9Q9NUM3 307 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 NBEAQ8NFP9 2946 aa17.13■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A0G2JNJ9 132 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 RELBQ01201 579 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 CT45A1Q5HYN5 189 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 OR52E5Q8NH55 327 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 CT45A3Q8NHU0 189 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF251Q9BRH9 671 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 Q9UFV3 132 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF98A6NK75 572 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 MKRN2OSH3BPM6 223 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 IFNA1P01562 189 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 KIR2DS2P43631 304 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB7AP51149 207 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 SELENOVP59797 346 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 SPCS3P61009 180 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 FFAR4Q5NUL3 377 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 ADAM5Q6NVV9 412 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 DOLPP1Q86YN1 238 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 C1QL4Q86Z23 238 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa17.12■□□□□ 0.33
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF439Q8NDP4 499 aa17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms