RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 AVPI1Q5T686 147 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 HRH4Q9H3N8 390 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 IGHV2-70P01814 119 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 THBS3P49746 956 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R30P59541 319 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 SPINK9Q5DT21 86 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 ATP5SQ99766 215 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PPR1 153 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 ZP3P21754 424 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V0CP27449 155 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 DLX6P56179 175 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 OR2B8PP59922 312 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZRG5 221 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-201ENST00000331789 C19orf84I3L1E1 186 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 DANCRP0C864 163 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 BLOC1S1P78537 153 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 OR4S2Q8NH73 311 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 C1QL1O75973 258 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 CRYZL1O95825 349 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 CT45A6P0DMU7 189 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 CT45A5P0DMU8 189 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 CT45A7P0DMV0 189 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 NQO2P16083 231 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G5P39877 138 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 BTNL8Q6UX41 500 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 STPG2Q8N412 459 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 OR4C12Q96R67 309 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 MMP26Q9NRE1 261 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 RAB19A4D1S5 217 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 SHOXO15266 292 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 AGAP20933 346 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 FHITP49789 147 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 ERVK-16P61578 105 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TUSC1Q2TAM9 212 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 DTD1Q8TEA8 209 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 ADTRPQ96IZ2 230 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 PARP11Q9NR21 331 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 KRBOX1C9JBD0 128 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 RUNX1Q01196 453 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 AKR1C1Q04828 323 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 OR4A16Q8NH70 328 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TMEM140Q9NV12 185 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 DFFBO76075 338 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 RELBQ01201 579 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 C11orf42Q8N5U0 333 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 ZNF525Q8N782 197 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 LRBAP50851 2863 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 SCO1O75880 301 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 FSTL3O95633 263 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 CAMLGP49069 296 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 J3QR06 171 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 IFNA5P01569 189 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 IFNA17P01571 189 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 PRH1P02810 166 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 AARDQ4LEZ3 155 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 DTX2Q86UW9 622 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 ACACBO00763 2458 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 NUDT19A8MXV4 375 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 AGPAT2O15120 278 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 HBG1P69891 147 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 HBG2P69892 147 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 ZNF616Q08AN1 781 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 UQCC3Q6UW78 93 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 RAB39BQ96DA2 213 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 RHOVQ96L33 236 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-201ENST00000331789 TMEM231Q9H6L2 316 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms