RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 NABP2Q9BQ15 211 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ATP6V0CP27449 155 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 C14orf144Q96I85 54 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 GPR132Q9UNW8 380 aa9.3□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 CKAP5Q14008 2032 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 A0A0U1RQV5 110 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 P2RY1P47900 373 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 M0R2P5 195 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 CAPZBP47756 277 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 TMEM258P61165 79 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 Q6ZNX1 250 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ASB1Q9Y576 335 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 LNP1A1A4G5 178 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 M0QZQ0 153 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 HPRT1P00492 218 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 CD7P09564 240 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 PDLIM4P50479 330 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ATXN8Q156A1 80 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 NIT1Q86X76 327 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 SPSB2Q99619 263 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 TLNRD1Q9H1K6 362 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ETHE1O95571 254 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 WDR38Q5JTN6 314 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 WFDC12Q8WWY7 111 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 VKORC1Q9BQB6 163 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 MMP16P51512 607 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 FBXL15Q9H469 300 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 SPTA1P02549 2419 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 TRAV25A0A0B4J276 109 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ST3GAL2Q16842 350 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 TBX21Q9UL17 535 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ADGRB1O14514 1584 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 NKX2-6A6NCS4 301 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.925e-7■■■■■ 27.5
TNS3-201ENST00000311160 PIGYQ3MUY2 71 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 MPZL1O95297 269 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 NDUFB6O95139 128 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 FHITP49789 147 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 MRC1P22897 1456 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 PRTN3P24158 256 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 PLNP26678 52 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 ABHD12Q8N2K0 398 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 MPDZO75970 2070 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 CTAG1AP78358 180 aa9.27□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 MVB12AQ96EY5 273 aa9.27□□□□□ -0.92
TNS3-201ENST00000311160 F5P12259 2224 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 CTDSPLO15194 276 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 PRR35P0CG20 571 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 TMPRSS3P57727 454 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 SYS1Q8N2H4 156 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 MGST2Q99735 147 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 CBLN4Q9NTU7 201 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 CD28P10747 220 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 CXorf65A6NEN9 183 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 TMEM50BP56557 158 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 MPTX1A8MV57 137 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 CT55Q8WUE5 264 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 ABHD1Q96SE0 405 aa9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa9.26□□□□□ -0.93
TNS3-201ENST00000311160 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms