RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C16orf95Q9H693 158 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 MCUBQ9NWR8 336 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RNF114Q9Y508 228 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TNCP24821 2201 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 NBR2O15453 112 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFA3O95167 84 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 IL7P13232 177 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PROK1P58294 105 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF45Q02386 682 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 FOXL1Q12952 345 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 IDO2Q6ZQW0 420 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PDPNQ86YL7 162 aa7.2□□□□□ -1.26
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PDE4D-201ENST00000309641 NPBQ8NG41 125 aa7.2□□□□□ -1.26
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PDE4D-201ENST00000309641 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RSRP1Q9BUV0 290 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RRHO14718 337 aa7.19□□□□□ -1.26
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PDE4D-201ENST00000309641 SLC25A17O43808 307 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PGAM2P15259 253 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 UCP3P55916 312 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 NDPQ00604 133 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PJVKQ0ZLH3 352 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 MEF2DQ14814 521 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PSG5Q15238 335 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RTL8BQ17RB0 113 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM177Q53S58 311 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OR2T6Q8NHC8 308 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 HARBI1Q96MB7 349 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CLCC1Q96S66 551 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 BEX1Q9HBH7 125 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 M0QZK8 103 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 GPR31O00270 319 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SHOXO15266 292 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 MSMO1Q15800 293 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
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PDE4D-201ENST00000309641 ANK2Q01484 3957 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 DISC1C4P0D8 188 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 S1PR2O95136 353 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 IGHG2P01859 326 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CRYGBP07316 175 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RPA2P15927 270 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF585BQ52M93 769 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SSX9Q7RTT3 188 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SLC38A6Q8IZM9 456 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.18□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PLA2G10O15496 165 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 F2RP25116 425 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 CCR6P51684 374 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PIGPP57054 158 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 PLGLAQ15195 96 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TRIQKQ629K1 86 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 LIN54Q6MZP7 749 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 C12orf54Q6X4T0 127 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 SLC35E3Q7Z769 313 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF329Q86UD4 541 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 OR4S2Q8NH73 311 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-201ENST00000309641 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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