RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5C1Q8NGR4 320 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 MBD6Q96DN6 1003 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 TEX15Q9BXT5 2789 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 PRH1P02810 166 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 CD80P33681 288 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 COMMD1Q8N668 190 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 CD177Q8N6Q3 437 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF645Q8N7E2 425 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 ZBTB34Q8NCN2 500 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 MRGPRDQ8TDS7 321 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 C2CD4CQ8TF44 421 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB40CQ96S21 281 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 CACNG5Q9UF02 275 aa13.13□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV4-39P01824 125 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 FHITP49789 147 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF616Q08AN1 781 aa13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 C9JQL5 133 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 SPRY3O43610 288 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP6V0CP27449 155 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 SNCAP37840 140 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 PPOXP50336 477 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 MIDNQ504T8 468 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM217Q8N7C4 229 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 RFNGQ9Y644 331 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC168Q8NDH2 2452 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 VPS13CQ709C8 3753 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 SFTA3P0C7M3 94 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 EGR1P18146 543 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 CFHR2P36980 270 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2B11Q5JQS5 317 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 TPRX1Q8N7U7 411 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 OR13A1Q8NGR1 328 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB1BQ9H0U4 201 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2D2Q9H210 308 aa13.11□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 COLCA2A8K830 154 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 C17orf100A8MU93 164 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 SRRM5B3KS81 715 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 TXNL1O43396 289 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 SYNGR2O43760 224 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 F12P00748 615 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 CCL8P80075 99 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM90A1Q86YD7 464 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 FGFRL1Q8N441 504 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM68Q96MH6 324 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 FOXC2Q99958 501 aa13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 K7N7A8 449 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 PAX5Q02548 391 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 RFESDQ8TAC1 157 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM213BQ8TBF2 198 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 C5orf30Q96GV9 206 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2V2Q96R30 315 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 WSB1Q9Y6I7 421 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 AKAP9Q99996 3911 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 UMAD1C9J7I0 102 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM157AC9JC47 383 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF737O75373 536 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV1-46P01743 117 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 PAX1P15863 534 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 SSTR5P35346 364 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 SULT1A1P50225 295 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 RPL30P62888 115 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 DEFA6Q01524 100 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 PEA15Q15121 130 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 GUK1Q16774 197 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 SPRNQ5BIV9 151 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 Q5PR19 223 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 MEGF10Q96KG7 1140 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 ATP5SQ99766 215 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 DCTN5Q9BTE1 182 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 MMP24Q9Y5R2 645 aa13.09□□□□□ -0.31
TSNARE1-201ENST00000307180 LYNX1G3V0Z9 82 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 H3BP45 60 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 C15orf65H3BRN8 121 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SPINT2O43291 252 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 LYNX1P0DP58 116 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 EFNA4P52798 201 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SPCS3P61009 180 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 RAB4BP61018 213 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 MSMO1Q15800 293 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 MOGAT3Q86VF5 341 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms