RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
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GNPTAB-201ENST00000299314 SLC25A17O43808 307 aa20.69■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDM14Q9GZV8 571 aa20.69■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 SCGB1A1P11684 91 aa20.69■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 SRXN1Q9BYN0 137 aa20.69■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 RTN4RQ9BZR6 473 aa20.69■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 JPT1Q9UK76 154 aa20.69■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.69■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1B0GV90 55 aa20.69■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PS18 150 aa20.69■□□□□ 0.9
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GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa20.69■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2L6O14933 153 aa20.69■□□□□ 0.9
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GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.68■□□□□ 0.9
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GNPTAB-201ENST00000299314 ABHD12Q8N2K0 398 aa20.68■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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GNPTAB-201ENST00000299314 STPG3Q8N7X2 389 aa20.68■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 LEAP2Q969E1 77 aa20.68■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 SMIM10Q96HG1 83 aa20.68■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF506Q5JVG8 444 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM183AQ8IXX5 376 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa20.67■□□□□ 0.9
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GNPTAB-201ENST00000299314 MFAP4P55083 255 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 C2orf68Q2NKX9 166 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 ASPHD2Q6ICH7 369 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 TCF19Q9Y242 345 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 CSRP3P50461 194 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 LEMD1Q68G75 181 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 REC114Q7Z4M0 266 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 C7orf71A4D174 169 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 REG1AP05451 166 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 OR51G1Q8NGK1 321 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM70Q9BUB7 260 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa20.67■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 PQLC2LA1A4F0 135 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa20.66■□□□□ 0.9
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GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM171Q8WVE6 324 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 SGK494Q96LW2 274 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 C19orf24Q9BVV8 132 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BTX0 84 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 GREM1O60565 184 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 NABP2Q9BQ15 211 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 GCHFRP30047 84 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 PMS2CLQ68D20 193 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 CTHRC1Q96CG8 243 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 RAXQ9Y2V3 346 aa20.66■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM54Q969K7 222 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 PMCHL2Q9BQD1 86 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 IGKV3-15P01624 115 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 EFNB1P98172 346 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 SFXN3Q9BWM7 321 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 SCN3AQ9NY46 2000 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 AHRRA9YTQ3 701 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 CTSBP07858 339 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 DRAM1Q8N682 238 aa20.65■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 WNT9BO14905 357 aa20.64■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 COX5BP10606 129 aa20.64■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 PF4V1P10720 104 aa20.64■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 FGF5P12034 268 aa20.64■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 DLX6P56179 175 aa20.64■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF146Q15072 292 aa20.64■□□□□ 0.9
GNPTAB-201ENST00000299314 MYO7AQ13402 2215 aa20.64■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.64■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 TGIF1Q15583 401 aa20.64■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 SHISA5Q8N114 240 aa20.64■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 GDF9O60383 454 aa20.64■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPWQ5EE01 88 aa20.64■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 TCF24Q7RTU0 167 aa20.64■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa20.63■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 SPRED2Q7Z698 418 aa20.63■□□□□ 0.89
GNPTAB-201ENST00000299314 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
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