RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 BTNL8Q6UX41 500 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 LHFPL3Q86UP9 236 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 NKAIN3Q8N8D7 197 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX45Q8NA69 505 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4A5Q8NH83 315 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 MUL1Q969V5 352 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 OR14A2Q96R54 314 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CIB1Q99828 191 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 CSTL1Q9H114 145 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.84□□□□□ -1.47
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GVY2 172 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 J3QRE1 110 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 M0R1X1 148 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 UBBP0CG47 229 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CTRB1P17538 263 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB10P48595 397 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 UBE2KP61086 200 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFA5Q01523 94 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MED21Q13503 144 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CTRB2Q6GPI1 263 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MMD2Q8IY49 270 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF383Q8NA42 475 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PTX4Q96A99 478 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf58Q96LI9 332 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 Q96M66 194 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CENPOQ9BU64 300 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 BANF2Q9H503 90 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 RYR1P21817 5038 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP5D1E7EU14 171 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TSPAN4O14817 238 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB5BO43169 146 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2J3O76001 311 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 APELAP0DMC3 54 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 RANBP1P43487 201 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PJVKQ0ZLH3 352 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6AP1Q15904 470 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS8Q16651 343 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 Q499Y3 187 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF585BQ52M93 769 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 LIPKQ5VXJ0 399 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC23Q5W5X9 447 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SETD9Q8NE22 299 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 OR11H2Q8NH07 326 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS12Q96DT0 336 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 UQCC2Q9BRT2 126 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 AGMATQ9BSE5 352 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 HRH4Q9H3N8 390 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 THYN1Q9P016 225 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 MLXQ9UH92 298 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 APLNQ9ULZ1 77 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.82□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 IRGMA1A4Y4 181 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM213A2RRL7 107 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYGBP07316 175 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFA4P12838 97 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 HLA-DRB3P79483 266 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM187Q14656 261 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SSX1Q16384 188 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM19Q96E16 107 aa5.81□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.8□□□□□ -1.48
PGGT1B-201ENST00000296642 E9PI62 339 aa5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms