RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 GPHA2Q96T91 129 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 SLC2A9Q9NRM0 540 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TNCP24821 2201 aa10.54□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RNF212BA8MTL3 300 aa10.53□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 NBR2O15453 112 aa10.53□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.72
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CCDC42-201ENST00000293845 RLN1P04808 185 aa10.53□□□□□ -0.72
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CCDC42-201ENST00000293845 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa10.53□□□□□ -0.72
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CCDC42-201ENST00000293845 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.53□□□□□ -0.72
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CCDC42-201ENST00000293845 OR4S2Q8NH73 311 aa10.53□□□□□ -0.72
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CCDC42-201ENST00000293845 TMEM158Q8WZ71 300 aa10.53□□□□□ -0.72
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CCDC42-201ENST00000293845 FCGR3BO75015 233 aa10.52□□□□□ -0.72
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CCDC42-201ENST00000293845 CRYZL1O95825 349 aa10.52□□□□□ -0.72
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CCDC42-201ENST00000293845 Q8N2B8 174 aa10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 OR51H1Q8NH63 302 aa10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 CD300LFQ8TDQ1 290 aa10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 HARBI1Q96MB7 349 aa10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 SCGB3A2Q96PL1 93 aa10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 C5orf66Q9H5L9 145 aa10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 C16orf95Q9H693 158 aa10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF702PQ9H963 129 aa10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.72
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM89A2RUT3 159 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 RRHO14718 337 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 IGLV2-23P01705 113 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 PI3P19957 117 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 F2RP25116 425 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 BTCP35070 178 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 RAG2P55895 527 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 RPS16P62249 146 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 BLCAPP62952 87 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 C5orf64Q2M2E5 130 aa10.52□□□□□ -0.73
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CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D26Q86UD7 250 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 SPAG16Q8N0X2 631 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa10.52□□□□□ -0.73
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CCDC42-201ENST00000293845 OR4F5Q8NH21 305 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 C19orf24Q9BVV8 132 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS22Q9GZN4 317 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 KIAA1456Q9P272 454 aa10.52□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 COPZ2Q9P299 210 aa10.52□□□□□ -0.73
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CCDC42-201ENST00000293845 MPPED1O15442 326 aa10.51□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 LYRM1O43325 122 aa10.51□□□□□ -0.73
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CCDC42-201ENST00000293845 VSIG10L2P0DP72 767 aa10.51□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 PSG5Q15238 335 aa10.51□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 RASL11BQ9BPW5 248 aa10.51□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 VSIG4Q9Y279 399 aa10.51□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 MMP24Q9Y5R2 645 aa10.51□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 COL6A5A8TX70 2615 aa10.5□□□□□ -0.73
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CCDC42-201ENST00000293845 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 PEX14O75381 377 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFB6O95139 128 aa10.5□□□□□ -0.73
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CCDC42-201ENST00000293845 CCR6P51684 374 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2KP61086 200 aa10.5□□□□□ -0.73
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CCDC42-201ENST00000293845 FOXL1Q12952 345 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZS46 218 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 OR2T6Q8NHC8 308 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 PLEKHA2Q9HB19 425 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 COMMD9Q9P000 198 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 TBC1D24Q9ULP9 559 aa10.5□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CCDC42-201ENST00000293845 H0Y980 276 aa10.49□□□□□ -0.73
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