RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 TMEM144Q7Z5S9 345 aa12.48□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa12.48□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 DNAJC13O75165 2243 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 TMPRSS2O15393 492 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 UBE2G2P60604 165 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 PAX5Q02548 391 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 AESQ08117 197 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 FBXW9Q5XUX1 488 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 DERL1Q9BUN8 251 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 WASF3Q9UPY6 502 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 A0A0U1RQK1 487 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 ZNF320A2RRD8 509 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 OOEPA6NGQ2 149 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 C15orf62A8K5M9 175 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 EREGO14944 169 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 CD99P14209 185 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 IQCJQ1A5X6 159 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 LURAP1Q96LR2 239 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 HES4Q9HCC6 221 aa12.47□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 USF3Q68DE3 2245 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 GTF3C1Q12789 2109 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 LINC00473A8K010 186 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 WNT9BO14905 357 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 PDE6DO43924 150 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 NDUFB4O95168 129 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 C1QTNF9P0C862 333 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 CD82P27701 267 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 SLC35E4Q6ICL7 350 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 LINC00696Q6ZRV3 163 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 UBALD2Q8IYN6 164 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 ZNF114Q8NC26 417 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 ZFHX4Q86UP3 3567 aa12.46□□□□□ -0.41
SYP-201ENST00000263233 PGPEP1LA6NFU8 196 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 SPCS3P61009 180 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 CST9LP1Q5W188 147 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 Q6ZR03 302 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 SLC25A40Q8TBP6 338 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 MRGPRDQ8TDS7 321 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 NINJ1Q92982 152 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 COQ2Q96H96 371 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TAAR6Q96RI8 345 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 WDR83OSQ9Y284 106 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 PXMP4Q9Y6I8 212 aa12.46□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 A0A1B0GUS0 222 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 J3QW42 95 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TFF1P04155 84 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TEX38Q6PEX7 206 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 ZNF826PQ6ZT77 177 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 RAB1CQ92928 201 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 KCNIP2Q9NS61 270 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TDGF1P13385 188 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 CD1BP29016 333 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 FOXL1Q12952 345 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 PSG7Q13046 419 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TMEM249Q2WGJ8 235 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 IMMP2LQ96T52 175 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 SPRY4Q9C004 299 aa12.45□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 MARCH11A6NNE9 402 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 IQCF6A8MYZ5 107 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 NUPR1O60356 82 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 WISP2O76076 250 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 IGHV3-43DP0DP04 118 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 EDDM3BP56851 147 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 GABRA6Q16445 453 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 NEU1Q99519 415 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 FKBP11Q9NYL4 201 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 ABI3Q9P2A4 366 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TMEM210A6NLX4 147 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TCAPO15273 167 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 OR9G9P0C7N8 305 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 GCH1P30793 250 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 SSTR5P35346 364 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 GABRA2P47869 451 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 MEOX1P50221 254 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 ZNF124Q15973 351 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 C11orf53Q8IXP5 236 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 ELOVL5Q9NYP7 299 aa12.44□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 F6UZH7 168 aa12.43□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 SCGB1D1O95968 90 aa12.43□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 ACP1P24666 158 aa12.43□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 RAB4BP61018 213 aa12.43□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 TPRX1Q8N7U7 411 aa12.43□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 SGMS2Q8NHU3 365 aa12.43□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 SFRP2Q96HF1 295 aa12.43□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 SNHG12Q9BXW3 62 aa12.43□□□□□ -0.42
SYP-201ENST00000263233 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.9 ms