RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 FUT9Q9Y231 359 aa7.71□□□□□ -1.17
PTPRB-201ENST00000261266 SCO1O75880 301 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 UCP1P25874 307 aa7.71□□□□□ -1.18
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PTPRB-201ENST00000261266 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 LAIR2Q6ISS4 152 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRB-201ENST00000261266 OR4C12Q96R67 309 aa7.68□□□□□ -1.18
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