RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 NKX2-8O15522 239 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 FAM90A15PP0C7V4 464 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 FAM90A13PP0C7W8 464 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 FAM90A14PP0C7W9 464 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 FAM90A24PP0C7X0 464 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 MIC13Q5XKP0 118 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 OR2T10Q8NGZ9 312 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 IMMP2LQ96T52 175 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.25□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SPRY3O43610 288 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV3-48P01763 117 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 C1QTNF9P0C862 333 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 MYOD1P15172 320 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 DDTP30046 118 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 GNG10P50151 68 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC29Q8WV35 223 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 COL4A2P08572 1712 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC30A6NM36 301 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 RNF212BA8MTL3 300 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SELLP14151 372 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 HES3Q5TGS1 186 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 VWA1Q6PCB0 445 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SMPD2O60906 423 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 GNB2P62879 340 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SERF2P84101 59 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZR03 302 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 R3HDM4Q96D70 268 aa11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 MARCH11A6NNE9 402 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFB7P17568 137 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF83P51522 516 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 DEFB123Q8N688 67 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM45BQ96B21 275 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 APC2O95996 2303 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087WWC5 75 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV3A0A0B4J244 114 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV1-2P23083 117 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 TCL1AP56279 114 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 C14orf144Q96I85 54 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SERTAD4Q9NUC0 356 aa11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 B4E171 279 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SLC17A3O00476 420 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 YKT6O15498 198 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 TSPAN7P41732 249 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 C1QL4Q86Z23 238 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SGMS2Q8NHU3 365 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 PRDM13Q9H4Q3 707 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 SPINT2O43291 252 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 AMBPP02760 352 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 OR1P1Q8NH06 330 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 PITPNC1Q9UKF7 332 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 B4DEV8 164 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 KBTBD11O94819 623 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00470Q9BZP3 86 aa11.22□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 TACC2O95359 2948 aa11.21□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GW64 132 aa11.21□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 CEACAM1P13688 526 aa11.21□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.21□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.21□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 YPEL4Q96NS1 127 aa11.21□□□□□ -0.61
TMOD1-201ENST00000259365 RRHO14718 337 aa11.21□□□□□ -0.62
TMOD1-201ENST00000259365 CD1BP29016 333 aa11.21□□□□□ -0.62
TMOD1-201ENST00000259365 ERVK-16P61578 105 aa11.21□□□□□ -0.62
TMOD1-201ENST00000259365 FOXF2Q12947 444 aa11.21□□□□□ -0.62
TMOD1-201ENST00000259365 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
TMOD1-201ENST00000259365 MLNRO43193 412 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms