RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 OR2A7Q96R45 310 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 ING3Q9NXR8 418 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 PIPOXQ9P0Z9 390 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.63□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 BET1O15155 118 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 IGLV2-14P01704 120 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 HBZP02008 142 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 RAB13P51153 203 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 RND3P61587 244 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 BLCAPP62952 87 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 HCP5Q6MZN7 132 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 OR1L1Q8NH94 360 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 OR10J5Q8NHC4 309 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 GALNT14Q96FL9 552 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 PRR25Q96S07 402 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 TCF19Q9Y242 345 aa8.62□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 G3V3Q6 166 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 SSNA1O43805 119 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 PGAM2P15259 253 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 AKR1C4P17516 323 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 SSTR5P35346 364 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 LGALS4P56470 323 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 HERV-K104P61576 105 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 EDDM3AQ14507 147 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 TOMM40LQ969M1 308 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 GALMQ96C23 342 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 SLC2A9Q9NRM0 540 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.61□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 FAM172BPA6NC97 362 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 A6NDX4 124 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 C1QBP02746 253 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 ANXA3P12429 323 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 H2BFSP57053 126 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 PIGPP57054 158 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 FXYD4P59646 89 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
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APOC3-201ENST00000227667 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 UBALD1Q8TB05 177 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 ARL11Q969Q4 196 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 NAA60Q9H7X0 242 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 RDH8Q9NYR8 311 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 GPR31O00270 319 aa8.59□□□□□ -1.03
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APOC3-201ENST00000227667 MPPED1O15442 326 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 SPINT2O43291 252 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 YPEL1O60688 119 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 JTBO76095 146 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 VAMP1P23763 118 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 CD34P28906 385 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 CEACAM6P40199 344 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 EDDM3BP56851 147 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 TMEM187Q14656 261 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 GNMTQ14749 295 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.59□□□□□ -1.03
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APOC3-201ENST00000227667 PRR18Q8N4B5 295 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 LRTM2Q8N967 370 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 ASB13Q8WXK3 278 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 AKR1E2Q96JD6 320 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 YPEL2Q96QA6 119 aa8.59□□□□□ -1.03
APOC3-201ENST00000227667 PHB2Q99623 299 aa8.59□□□□□ -1.03
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