RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 CENPSQ8N2Z9 138 aa15.97■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.97■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.97■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 WASHC3Q9Y3C0 194 aa15.97■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 A0A0B4J293 547 aa15.96■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 S1PR2O95136 353 aa15.96■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 H2AFB2P0C5Z0 115 aa15.96■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 DHODHQ02127 395 aa15.96■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.96■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 CHIAQ9BZP6 476 aa15.96■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 TCF19Q9Y242 345 aa15.96■□□□□ 0.15
KDELR3-201ENST00000216014 TNCP24821 2201 aa15.96■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa15.95■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 PTTG1O95997 202 aa15.95■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 IGLV2-23P01705 113 aa15.95■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 HES1Q14469 280 aa15.95■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 GLYATL2Q8WU03 294 aa15.95■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 ADTRPQ96IZ2 230 aa15.95■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.95■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa15.95■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 RPA2P15927 270 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 BRS3P32247 399 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 AANATQ16613 207 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 ANKRD55Q3KP44 614 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 ZFAND2BQ8WV99 257 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TPSG1Q9NRR2 321 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 H0Y980 276 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 MOSP00540 346 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 APOA2P02652 100 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 LPAR6P43657 344 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 MECP2P51608 486 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM187Q14656 261 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 PDPNQ86YL7 162 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 SSMEM1Q8WWF3 244 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 SCGB3A2Q96PL1 93 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15.94■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 AMY1AP04745 511 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 OR4E1P0C645 316 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM11P17152 192 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 MC5RP33032 325 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 CATR1Q13166 79 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 OXA1LQ15070 435 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 RGS21Q2M5E4 152 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM177Q53S58 311 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM128Q5BJH2 165 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 DHRS2Q13268 280 aa15.92■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 OR2T10Q8NGZ9 312 aa15.92■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 C9orf170A2RU37 121 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 FAM106CPP0CH98 169 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 VAMP1P23763 118 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 UCP1P25874 307 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 HILS1P60008 231 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 RPS16P62249 146 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 RTL8BQ17RB0 113 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 LIN54Q6MZP7 749 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 PLET1Q6UQ28 207 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 Q6ZS46 218 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 OR4S2Q8NH73 311 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 GALNT14Q96FL9 552 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM222Q9H0R3 208 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 VPREB3Q9UKI3 123 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 RNF212BA8MTL3 300 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 SFT2D2O95562 160 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 IGKV1-5P01602 117 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 SSX9Q7RTT3 188 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 LURAP1LQ8IV03 231 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 HARBI1Q96MB7 349 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.91■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 C2CD3Q4AC94 2353 aa15.9■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 A0A0G2JRQ6 117 aa15.9■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 ARHGDIBP52566 201 aa15.9■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 PJVKQ0ZLH3 352 aa15.9■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 PSG5Q15238 335 aa15.9■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 Q8N9W7 124 aa15.9■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.9■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 FBXL15Q9H469 300 aa15.9■□□□□ 0.14
KDELR3-201ENST00000216014 TRAV3A0A0B4J244 114 aa15.89■□□□□ 0.13
KDELR3-201ENST00000216014 SHOXO15266 292 aa15.89■□□□□ 0.13
KDELR3-201ENST00000216014 SLC25A17O43808 307 aa15.89■□□□□ 0.13
KDELR3-201ENST00000216014 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
KDELR3-201ENST00000216014 CRYGBP07316 175 aa15.89■□□□□ 0.13
KDELR3-201ENST00000216014 S100GP29377 79 aa15.89■□□□□ 0.13
KDELR3-201ENST00000216014 G6PCP35575 357 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms