RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TVP23C	Q96ET8	276 aa		10.93	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	H2BFWT	Q7Z2G1	175 aa		10.93	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.93	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	MUCL1	Q96DR8	90 aa		10.93	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		10.93	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF292	O60281	2723 aa		10.93	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152		M0R1B8	84 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1D-33	P01593	117 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1-33	P01594	117 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	IGLV1-44	P01699	117 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	BCL2	P10415	239 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	DTD1	Q8TEA8	209 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	GNG12	Q9UBI6	72 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	AHRR	A9YTQ3	701 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	SPINT2	O43291	252 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	DEFA4	P12838	97 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		10.92	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	CGA	P01215	116 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	EDDM3B	P56851	147 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	ERVFRD-1	P60508	538 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	SERF2	P84101	59 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	OR51M1	Q9H341	326 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A22	Q9H936	323 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	SPRY3	O43610	288 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	IGHV2-70	P01814	119 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152		Q8WTZ3	238 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	LHX4	Q969G2	390 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	S100PBP	Q96BU1	408 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	IFNL4	K9M1U5	179 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	FCGR3B	O75015	233 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	CXCL1	P09341	107 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	ACSM6	Q6P461	480 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	OR2V2	Q96R30	315 aa		10.91	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN14	O95500	239 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152		P0C879	139 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	FGF7	P21781	194 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	SST	P61278	116 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	TFF3	Q07654	80 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	P2RY6	Q15077	328 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	ELOB	Q15370	118 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF124	Q15973	351 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		10.9	□□□□□ -0.66
BRF1-222	ENST00000635152	C15orf65	H3BRN8	121 aa		10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PROP1	O75360	226 aa		10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF737	O75373	536 aa		10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	GPR12	P47775	334 aa		10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	YPEL4	Q96NS1	127 aa		10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	ACACA	Q13085	2346 aa		10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		10.9	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	UBE2C	O00762	179 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	IFNA17	P01571	189 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	S100P	P25815	95 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	UTF1	Q5T230	341 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
BRF1-222	ENST00000635152	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		10.89	□□□□□ -0.67

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