RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM71F2Q6NXP2 309 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 BEND2Q8NDZ0 799 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 CD300LFQ8TDQ1 290 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM186Q96B77 213 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 ADTRPQ96IZ2 230 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP26Q9NRE1 261 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPN13Q12923 2485 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPNS1-215ENST00000628018 FGL1Q08830 312 aa20.27■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 COMMD9Q9P000 198 aa20.27■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa20.27■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CT45A6P0DMU7 189 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CT45A5P0DMU8 189 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CT45A7P0DMV0 189 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DRB5Q30154 266 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF383Q8NA42 475 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 OR13D1Q8NGV5 346 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 MBD6Q96DN6 1003 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SIRT7Q9NRC8 400 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 GSKIPQ9P0R6 139 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 FCGR3BO75015 233 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 IGKV1-5P01602 117 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 COX7A1P24310 79 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 KIR2DS2P43631 304 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PNKDQ8N490 385 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 OR11H6Q8NGC7 330 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SIRPDQ9H106 197 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0G2JRQ6 117 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 S1PR2O95136 353 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMB6P28072 239 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SPIN2AQ99865 258 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 MPC2O95563 127 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 HPRT1P00492 218 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 IL3RAP26951 378 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 HCP5Q6MZN7 132 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR146Q96CH1 333 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHA2Q9HB19 425 aa20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP9P14780 707 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 USF1P22415 310 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf87Q6NUJ2 197 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 VMO1Q7Z5L0 202 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4P4Q8NGL7 312 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 FASNP49327 2511 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 ATG12O94817 140 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A4P12235 298 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A6P12236 298 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 AKR1C2P52895 323 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB32Q13637 225 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4D5Q8NGN0 318 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 GRPEL2Q8TAA5 225 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 INSIG2Q9Y5U4 225 aa20.22■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A096LNT2 108 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 P0C879 139 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4S2Q8NH73 311 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 LPAR2Q9HBW0 351 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP24Q9Y5R2 645 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 APCP25054 2843 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-215ENST00000628018 CSMD2Q7Z408 3487 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GU03 582 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 HMSDA8MTL9 139 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 KRASP01116 189 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 G6PCP35575 357 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 REG1BP48304 166 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 KLRD1Q13241 179 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZRM9 215 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM219AQ8IW50 185 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 C9orf62Q8N4C0 152 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5AN1Q8NGI8 311 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 NABP2Q9BQ15 211 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 POLQO75417 2590 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCA12Q86UK0 2595 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 ODF3BA8MYP8 253 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YIZ8 118 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 LY6LH3BQJ8 138 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TOX4O94842 621 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP6Q8TBB0 222 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-215ENST00000628018 PCGF1Q9BSM1 259 aa20.19■□□□□ 0.82
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