RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
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C9orf170-201ENST00000623052 C15orf65H3BRN8 121 aa11.13□□□□□ -0.63
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C9orf170-201ENST00000623052 IL2RGP31785 369 aa11.13□□□□□ -0.63
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C9orf170-201ENST00000623052 LOXL4Q96JB6 756 aa11.12□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
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C9orf170-201ENST00000623052 RAB29O14966 203 aa11.11□□□□□ -0.63
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C9orf170-201ENST00000623052 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.11□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.11□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.11□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM7Q9BQ49 75 aa11.11□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 BSNQ9UPA5 3926 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.1□□□□□ -0.63
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C9orf170-201ENST00000623052 CATR1Q13166 79 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 GCSAMLQ5JQS6 135 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
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C9orf170-201ENST00000623052 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 PARLQ9H300 379 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 NAT8Q9UHE5 227 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 SEC14L6B5MCN3 397 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 ADIRFQ15847 76 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 LURAP1Q96LR2 239 aa11.1□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 CCL11P51671 97 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 LTC4SQ16873 150 aa11.09□□□□□ -0.63
C9orf170-201ENST00000623052 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.09□□□□□ -0.63
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